Isolation of a New Agar Degrading Bacterium, Maribacter sp. SH-1 and Characterization of its Agarase

이창은; 이솔지; 이동근; 이상현

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자료유형: 학술저널

저자정보: 이창은 이솔지 이동근 이상현

저널정보: 한국미생물생명공학회 한국미생물·생명공학회지 한국미생물·생명공학회지 제44권 제2호

발행연도: 2016.1

수록면: 156 - 162 (7page)

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In this study, we isolated a new agar-degrading marine bacterium and characterized its agarase. An agardegrading marine bacterium SH-1 was isolated from seawater, collected from the seashore of Namhae in Gyeongnam province, Korea, and cultured in marine agar 2216 media. It was identified as Maribacter. sp. SH-1 by phylogenetic analyses, based on 16S rRNA gene sequence. The extracellular agarase was extracted from culture media of Maribacter sp. SH-1 and characterized. Its relative activities were 56, 62, 94, 100, and 8% at 20, 30, 40, 50, and 60°C, respectively, whereas 15, 100, 60, and 21% relative activities were observed at pH 5, 6, 7, and 8, respectively. Its extracellular agarase exhibited maximum activity (231 units/l) at pH 6.0 and 50°C, in 20 mM Tris-HCl buffer. Therefore, this agarase would be applicable as it showed the maximum activity at the temperature at which the agar is in a sol state. Furthermore, the agarase activities remained over 90% at 20, 30, and 40°C after 0.5 h exposure at these temperatures. Thin layer chromatography analysis suggested that Maribacter sp. SH-1 produces extracellular β-agarase, as it hydrolyzes agarose to produce neoagarooligosaccharides, such as neoagarohexaose (34.8%), neoagarotetraose (52.2%), and neoagarobiose (13.0%). Maribacter sp. SH-1 and its β−agarase would be useful for the production of neoagarooligosaccharides, which shows functional properties, like skin moisturizing, skin whitening, inhibition of bacterial growth, and delay in starch degradation.

#Agar-degrading bacterium #β-agarase #marine bacterium #Maribacter sp. SH-1 #neoagarooligosaccharides

참고문헌 (23)

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Bannikova GE / 2008 / The thermophilic bacteria hydrolyzing agar: characterization of thermostable agarase / J. Biol. Chem. Microbiol 44:366~369

Cha JA / 2009 / Isolation and enzymatic properties of agarolytic bacteria

차정아 / 2009 / 한천분해세균 Cellvibrio mixtus SC-22의 분리 및 효소적 특성 / Journal of Applied Biological Chemistry 52(4):157~162

지원재 / 2013 / 홍조류로부터 신규 한천분해미생물 Alteromonas macleodii subsp. GNUM08120의 분리 및 동정 / 한국미생물·생명공학회지 41(1):8~16

Fu Xiao Ting / 2009 / Gene Cloning, Expression, and Characterization of a β-Agarase, AgaB34, from Agarivorans albus YKW-34 / Journal of Microbiology and Biotechnology 19(3):257~264

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