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대한기계학회 대한기계학회 논문집 A권 대한기계학회논문집 A권 제30권 제7호
발행연도
2006.7
수록면
841 - 848 (8page)

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Many researchers are developing computational prediction methods for protein tertiary structures to get much more information of protein. These methods are very attractive on the aspects of breaking technologies of computer hardware and simulation software. One of the computational methods for the prediction is a fragment assembly method which shows good ab initio predictions at several cases. There are many barriers, however, in conventional fragment assembly methods. Argues on protein energy functions and global optimization to predict the structures are in progress for example. In this study, a new prediction method for protein structures is proposed. The proposed method mainly consists of two parts. The first one is a fragment assembly which uses very shot fragments of representative proteins and produces a prototype of a given sequence query of amino acids. The second one is a global optimization which folds the prototype and makes the only protein structure. The goodness of the proposed method is shown through numerical experiments.
#Optimization(최적화) #Structure Design(구조설계) #Protein(단백질) #Fragment Assembly(단편조립법) #3-Residue Fragment(3-잔기아미노산) #Folding Optimization(접힘최적화)

목차

Abstract
1. 서론
2. 아미노산 단편조립
3. 구조 접힘(Folding) 최적화
4. 단백질 구조예측
5. 결론
후기
참고문헌

참고문헌 (19)

참고문헌 신청
Branden, C. and Tooze, J., 1999, Introduction to Protein Structure, Garland Publishing, New York. google schola Moult, J., Hubbard, T., Fidelis, K. and Pedersen, J.T., 1999, "Critical Assessment of Methods of Protein Structure Prediction (CASP): Round III," Proteins, Suppl. 3, pp. 2~6. google schola Moult, J., Fidelis, K., Zemla, A. and Hubbard, T., 2001, "Critical Assessment of Methods of Protein Structure Prediction (CASP): Round IV," Proteins, Suppl.5, pp. 2~7. google schola Baker, D. and Sali, A., 2001, "Protein Structure Prediction and Structural Genomics," Science, Vol. 294, pp. 93~96. google schola Betancourt, M. and Skolnick, J., 2001, "Finding the Needle in a Haystack: Educing Native Folds from Ambiguous ab initio Protein Structure Predictions," Journal of Computational Chemistry, Vol. 22, pp. 339~353. google schola

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