단백질 이차 구조 예측을 위한 단백질 프로파일의 성능 비교

지상문

추천

검색

질문

자료유형: 학술저널

저자정보: 지상문 (Kyungsung University)

저널정보: 한국정보통신학회 한국정보통신학회논문지 한국정보통신학회논문지 제22권 제1호

발행연도: 2018.1

수록면: 26 - 32 (7page)

이용수

📌

연구주제

📖

연구배경

🔬

연구방법

🏆

연구결과

초록· 키워드

오류제보하기

단백질의 이차구조는 단백질의 진화, 구조, 기능을 연구하는데 중요한 정보이다. 단백질 서열 정보만을 이용하여 단백질의 이차 구조를 예측하는 분야에 심층 학습 방법들이 최근 들어 활발히 적용되고 있다. 이러한 방법에서 널리 사용되는 입력은 단백질 서열을 변환하여 만들어진 단백질 프로파일이다. 본 논문에서는 효과적인 단백질 프로파일을 얻기 위하여 단백질 서열 탐색 방법으로 PSI-BLAST와 더불어서 HHblits를 사용하였다. 단백질 프로파일의 구성에 사용되는 상동 단백질 서열을 결정하기 위한 유사도 문턱치와 상동 단백질 서열 정보를 반복적으로 사용하는 회수를 조절하였다. 합성곱 신경망과 순환 신경망을 사용하여 단백질 이차구조를 예측하였는데, 진화적 정보를 한번만 추가하여 만들어진 단백질 프로파일이 효과적이었다.

#단백질 이차 구조 #단백질 프로파일 #단백질 서열 탐색 #PSI-BLAST #HHblits #Protein secondary structure #Protein profile #Protein sequence search #PSI-BLAST #HHblits

참고문헌 (23)

참고문헌 신청

[학술지(정기간행물)] - D. Baker / 2001 / Protein structure prediction and structural genomics / Science 294 : 93 ~ 96

[단행본] - H. Lodish / 2007 / Molecular Cell Biology, sixth Ed. / W.H. Freeman and Company

[학술지(정기간행물)] - H. W. Buchan / 2013 / Scalable web services for the PSIPRED protein analysis workbench / Nucleic Acids Research 41 : W72 ~ W76

[학술지(정기간행물)] - C. N. Magnan / 2014 / SSpro/ACCpro 5: almost perfect prediction of protein secondary structure and relative solvent accessibility using profiles, machine learning and structural similarity / Bioinformatics 30 : 2592 ~ 2597

[학술지(정기간행물)] - J. Zhou / 2014 / Deep supervised convolutional generative stochastic network for protein secondary structure prediction / Journal of Machine Learning Research W&CP 32 : 745 ~ 753

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

지상문

소속기관 경성대학교

주요연구분야 공학 > 전기전자공학 > 정보통신공학 TOP 10% 공학 > 컴퓨터학

논문수 16 이용수 2,468

이 논문과 함께 이용한 논문

단백질 서열의 상동 관계를 가중 조합한 단백질 이차 구조 예측

지상문 한국정보통신학회논문지 2016 .09

PSAML를 기반으로 한 단백질 구조 비교

김진홍 , 안건태 , 조민수 외 2명 프로그래밍언어논문지 2002 .10

최적설계 기법을 이용한 단백질 3차원 구조 예측

정민중 , 이준성 대한기계학회 논문집 A권 2006 .07

알파폴드 (AlphaFold): 인공지능 기반 단백질 3차구조 예측

주기형 BT NEWS 2019 .04

수수에서 SELDI - TOF - MS를 이용한 저분자 단백질 프로파일링을 위한 희석배수의 최적화

박세준 , 박준영 , 남윤정 외 15명 한국잡초학회 별책(학술대회 초록집) 2011 .12

최근 본 자료

전체보기

UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2018-004-001755034

구분	그룹	데이터 항목
AI 학습용 데이터	원문	원문 PDF 파일
AI 학습용 데이터	원문 + 메타 (기본/상세)	원문 PDF 파일 및 서지정보 CSV
대량 구매용 데이터	B2B 구독 방식	특정 자료 한정으로 원문 접근 권한 부여
대량 구매용 데이터	URL 전달 방식	바로 PDF 뷰어를 열람할 수 있는 URL 제공

구분	그룹	데이터 항목
AI 학습용 데이터	기본 메타	발행기관명, 간행물명, 권호명, 권(vol), 호(issue), 통권, 발행연도, 발행월, 논문명, 저자명, 시작페이지, 종료페이지, 전체페이지, 상세페이지URL
상세 메타 데이터	발행기관 메타	발행기관 이명, 영문명, 창립연도, 홈페이지URL, 발행기관 소개
	간행물 메타	부제목, 간행물 유형, ISSN, ISBN, 최초발행연도, 폐간연도, 간행빈도, 발행주기, 등재사항, 이용수, 피인용수, 권호수, 논문수, 표지이미지
	논문 메타	작성 언어, 부제목, 대등제목, 목차, 키워드, 초록, 이미지, 참고문헌, 이용수, 피인용수, 논문활용도, DBpia통합주제분류, KDC분류, DDC분류, 한국연구재단분류, UCI, DOI
	저자 메타	소속기관, 소속부서, 직급, 연구분야, 연구키워드, 이용수, 피인용수, 저자 논문활용도

구분	그룹	데이터 항목
※ 결합형/맞춤형 메타 데이터는 신청 내용에 따라 다양하게 제공 가능
이용순위 정보	주제분야별 많이 이용된 논문	“인문학”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	이용기관별 많이 이용된 논문	“중고등학교”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	세부기관별 많이 이용된 논문	“서울대학교”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	키워드별 많이 이용된 논문	“Chat GPT”에서 많이 이용된 논문 TOP100
키워드 정보	많이 이용된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 이용된 키워드
	많이 발행된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 발행된 키워드
	많이 검색된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 검색된 키워드
	연구 트렌드 키워드	특정 키워드 연관 연구동향 분석 데이터 키워드

논문 기본 정보

초록· 키워드

AI 요약

연구주제

연구배경

연구방법

연구결과

주요내용

목차

참고문헌 (23)

함께 읽어보면 좋을 논문

이 논문의 저자 정보

이 논문과 함께 이용한 논문

최근 본 자료

댓글(0)