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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2015.12
- 수록면
- 3,011 - 3,016 (6page)
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단백질의 삼차원 구조를 단백질의 국부적 구조인 단백질 조각의 일차원적 나열로 표현하면, 단백질 구조의 분석, 모델링, 탐색, 예측 등에 효과적으로 응용될 수 있다. 본 논문에서는 자연 상태의 단백질 구조를 정확하게 나타낼 수 있는 단백질 조각 라이브러리를 구성하기 위하여, 대규모 단백질 구조 자료를 이용 할 수 있는 거리 척도들의 효과적인 조합을 조사하였다. 단백질 조각 라이브러리를 구성하기 위해 군집화를 사용하였다. 초기 군집화 단계에서는 가장 계산량이 작은 내부 알파탄소간 거리를 사용하였고, 군집의 확장단계에서는 내부 알파탄소간 거리, 비네-코시거리와 평균 제곱근 오차를 조합하여 사용하였다. 제안한 거리 척도의 조합으로 대규모 자료를 이용하여 단백질 조각 라이브러리를 구성하였다. 구성된 라이브러리를 사용하여 단백질 구조를 나타내는 실험에서 작은 평균 제곱근 오차가 발생함을 확인하였다.
목차
요약
ABSTRACT
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 단백질 구조간의 거리척도
Ⅲ. 거리척도들의 조합을 사용한 단백질 조각 라이브러리 구성 방법
Ⅳ. 실험 및 결과
Ⅴ. 결론
REFERENCES
참고문헌 (10)
참고문헌 신청
[학술지(정기간행물)] - A. G. de Brevern / 2000 / Bayesian probabilistic approach for predicting backbone structures in terms of protein blocks / Proteins 41 : 271 ~ 287
[학술지(정기간행물)] - R. Kolodny / 2002 / Small libraries of protein fragments model native protein structures accurately / Journal of Molecular Biology 323 : 297 ~ 307
[학술지(정기간행물)] - A. C. Camproux / 2004 / A hidden markov model derived structural alphabet for proteins / Journal of Molecular Biology 339 : 591 ~ 605
[학술지(정기간행물)] - T. Hamelryck / 2006 / Sampling realistic protein conformations using local structural bias / PLoS Comput. Biol 2 (e131) : 1121 ~ 1133
[학술지(정기간행물)] - S. C. Li / 2008 / Fragment-HMM: A new approach to protein structure prediction / Protein Science 17 : 1025 ~ 1934
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