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학술저널
저자정보
김정안 (부산대학교) 홍창표 ((주)테라젠) 김대수 (한국생명공학연구원) 문재우 ((주)테라젠이텍스) 최유리 (부산대학교) 외정우 (부산대학교) 권윤정 (부산대학교) 이자랑 (부산대학교) 정이든 (서울아산병원(울산대부설)) 배진한 (부산대학교) 최봉환 (농촌진흥청) 고준수 ((주)테라젠) 송상훈 ((주)테라젠) 안궁 (부산대학교) 하홍석 (고려대학교) 양영목 (건국대학교) 이학교 (한경대학교) 박경도 (한경대학교) 한규동 (단국대학교) 이주미 (동남권원자력의학원) 차희재 (고신대학교) Selvam Ayarpadikannan (부산대학교) 조병욱 (부산대학교) 박종화 (테라젠바이오연구소) 도경탁 (한경대학교) 김희수 (부산대학교)
저널정보
한국분자세포생물학회 Molecules and Cells Molecules and Cells 제38권 제3호
발행연도
2015.3
수록면
210 - 220 (11page)
DOI
10.14348/molcells.2015.2138

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2015

Genome-Wide Analysis of DNA Methylation beforeand after Exercise in the Thoroughbred Horse with MeDIP-Seq
김정안 ,  홍창표 ,  김대수 외 24명 Molecules and Cells 2015.03 학술저널

2014

The Change of Global DNA Methylation patterns before and after Exercise in the Thoroughbred Horse via MeDIP-Seq
김정안 ,  홍창표 ,  최유리 외 8명 한국실험동물학회 학술발표대회 논문집 2014.08 학술대회자료

초록· 키워드

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Athletic performance is an important criteria used for the selection of superior horses. However, little is known about exercise-related epigenetic processes in the horse. DNA methylation is a key mechanism for regulating gene expression in response to environmental changes. We carried out comparative genomic analysis of genome-wide DNA methylation profiles in the blood samples of two different thoroughbred horses before and after exercise by methylated-DNA immunoprecipitation sequencing (MeDIPSeq). Differentially methylated regions (DMRs) in the preand post-exercise blood samples of superior and inferior horses were identified. Exercise altered the methylationpatterns. After 30 min of exercise, 596 genes were hypomethylated and 715 genes were hypermethylated in the superior horse, whereas in the inferior horse, 868 genes were hypomethylated and 794 genes were hypermethylated. These genes were analyzed based on gene ontology (GO) annotations and the exercise-related pathway patterns in the two horses were compared. After exercise, gene regions related to cell division and adhesion were hypermethylated in the superior horse, whereas regions related to cell signaling and transport were hypermethylated in the inferior horse. Analysis of the distribution of methylated CpG islands confirmed the hypomethylation in the gene-body methylation regions after exercise. The methylation patterns of transposable elements also changed after exercise. Long interspersed nuclear elements (LINEs) showed abundance of DMRs. Collectively, our results serve as a basis to study exercise-based reprogramming of epigenetic traits.
#DNA methylation #exercise #MeDIP-Seq #thoroughbred horse #transposable elements

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Al-Moundhri, M. S. / 2010 / The prognostic significance of whole blood global and specific DNA methylation levels in gastric adenocarcinoma / PLoS One 5:15585 google schola Allen, D. G. / 2008 / Impaired calcium release during fatigue / J. Appl. Physiol 104:296~305 google schola Ball, M. P. / 2009 / Targeted and genomescale strategies reveal gene-body methylation signatures in human cells / Nat. Biotechnol 27:361~368 google schola Barres, R. / 2012 / Acute exercise remodels promoter methylation in human skeletal muscle / Cell Metab 15:405~411 google schola Bird, A. / 2002 / DNA methylation patterns and epigenetic memory / Genes Dev 16:6~21 google schola

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