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학술저널
저자정보
김철 (한국한의학연구원 정보연구센터) 예상준 (한국한의학연구원 정보연구센터) 김진현 (한국한의학연구원 정보연구센터) 김상균 (한국한의학연구원 정보연구센터) 장현철 (한국한의학연구원 정보연구센터) 김안나 (한국한의학연구원 정보연구센터) 남기엽 ([사]분자설계연구소) 송미영 (한국한의학연구원 정보연구센터)
저널정보
대한한의학방제학회 대한한의학방제학회지 대한한의학방제학회지 제18권 제2호
발행연도
2010.1
수록면
227 - 239 (13page)

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Objective : The purpose of this study was to develop the simulator which can analyze the anti-inflammatory effects of herbs based on e-cell, or the virtual cell. Method : We have ensured the medical herbs and its active compounds by investigating the oriental medicine records and NBCI(Biomedicine database). Also we have developed the web-based search system for confirming database related to anti-inflammation. We have researched the cell signal pathway related with inflammatory response control and established the mathematical model of herb interaction on selected signal pathway in e-cell. Finally we have developed the prototype which can confirm the result of this model visibly. Results : We constructed the database of 62 cases of anti-inflammatory active compounds in 61 cases of medical herbs which have been known anti-inflammation effects in the paper, 16 cases of inflammatory factors, 10 cases of signal pathways related with inflammatory response and 6,834 cases of URL(Uniform Resource Locator) of referenced papers. And we embodied the web-based research system, which can research this database. User can search basic and detailed information of medical plants related with anti-inflammatory by using information system. And user can acquire information on an active compounds, a signal pathway and a link URL of related paper. Among investigated ten pathways, we selected NF-${\kappa}B$, which plays important role in activation of immune system, and we searched the mechanisms of actions of proteins which could be components of this pathway. We reduced total network into IKK-$I{\kappa}B$ - NF-${\kappa}B$, and completed mathematic modeling by using ordinary differential equations and response variables of $I{\kappa}B-NF-{\kappa}B$ signaling model network which is suggested by Baltimore Group. We designed OED(Ordinary Differential Equation) for response of IKK, $I{\kappa}B$, $NF-{\kappa}B$ in e-cell's cytoplasm and nucleus, and measured whether an active compound of medicinal plants which is inputted by an user would have a anti-inflammation effects in obedience to change in concentration over time. The proposed model was verified by using experimental results of the papers which are listed on NCBI.
#anti-inflammation #e-cell #NF- ${kappa}B$ #simulator #Signal pathway

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李鍾馨 / 1990 / 方劑學의 重要性 / 大韓韓醫學方劑學會誌 1:5~9 google schola 생명공학정책연구센터 / 2009 / 약물전달시스템 및 활용 기술 google schola http://www.ndsl.kr google schola http://www.riss.kr google schola http://www.kosen21.org google schola

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