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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
고해수 (National Institute of Animal Science Rural Development Administration)
저널정보
충북대학교 동물의학연구소 Journal of Biomedical and Translational Research Journal of Biomedical and Translational Research 제19권 제1호
발행연도
2018.3
수록면
1 - 9 (9page)

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Cluster of differentiation (CD) 24 or heat stable antigen 24 (HSA) molecule is a mucin-type glycoprotein attached to the cell surface by glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor, promoting adhesive interactions between cells or in extracellular matrix. The aim of this study was to determine the not yet fully identified porcine CD24 gene and protein structure using computational analysis and to validate variants reported in exons of CD24 gene using direct sequencing. A total of 59 samples belonging to Yorkshire, Landrace, Berkshire, Jeju black pig and wild boar were used in the study. Human CD24 mRNA sequences were used as a reference and subjected to BLAST searches to retrieve the orthologous expressed sequence tags (ESTs) or cDNA sequences against NCBI and Ensemble databases. Assembled ESTs and retrieved cDNA sequences for the porcine CD24 gene were used for specific BLAST search to determine its genomic structure. We found porcine CD24 gene to consist of two exons and a relatively long intron. Second exon of porcine CD24 gene had a long 3’ untranslated region (UTR) and was very similar to that of human, mouse, rat, and sheep. The sequence homology of porcine CD24 protein was 65.38-84.62%, when analyzed with amino acid sequences of rat, mouse, human, cattle, and sheep CD24 protein. N-terminal signal sequence, O-glycosylation sites and GPI-anchoring signal sites were also predicted in pig, which showed these motifs to be evolutionary conserved across the species. Variant analysis in exonic regions of porcine CD24 among the multiple breeds showed that only second exon contained eight SNPs and three insertions in a 3’ UTR. Taken together, this study reports putative porcine CD24 gene and its protein structure using in silico approaches, which will be helpful for any further functional studies.
#CD24 #gene structure #glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored glycoprotein #pig

목차

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참고문헌 (30)

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Fang X / 2010 / CD24: from A to Z / Cellular and Molecular Immunology 7:100~103 Crossref Keller S / 2007 / CD24 is a marker of exosomes secreted into urine and amniotic fluid / Kidney Int 72:1095~1102 Crossref Kristiansen G / 2004 / Tumour biological aspects of CD24, a mucin-like adhesion molecule / Journal of molecular histology 35:255~262 google schola Yan W / 2013 / Increased invasion and tumorigenicity capacity of CD44+/CD24-breast cancer MCF7 cells in vitro and in nude mice / Cancer cell international 13:62 Crossref Aigner S / 1997 / CD24, a mucin-type glycoprotein, is a ligand for P-selectin on human tumor cells / Blood 89:3385~3395 google schola

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