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저자정보
Hye-Ran Kim (Dong-Eui Institute of Technology) Choong Won Seo (Dong-Eui Institute of Technology) Jae-Ho Lee (Keimyung University School of Medicine) Sang Jun Han (Pukyong National University) Jongwan Kim (Dong-Eui Institute of Technology)
저널정보
대한의생명과학회 대한의생명과학회지 대한의생명과학회지 제28권 제4호
발행연도
2022.12
수록면
260 - 275 (16page)

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Sterile alpha motif (SAM) domains bind to various proteins, lipids, and RNAs. However, these domains have not yet been analyzed as prognostic biomarkers. In this study, SAM domain containing 13 (SAMD13), a member of the SAM domain, was evaluated to identify a novel prognostic biomarker in various human cancers, including hepatocellular carcinoma (HCC). Moreover, we identified a correlation between SAMD13 expression and immune cell infiltration in HCC. We performed bioinformatics analysis using online databases, such as Tumor Immune Estimation Resource, UALCAN, Kaplan-Meier plotter, LinkedOmics, and Gene Expression Profiling Interactive Analysis2. SAMD13 expression in HCC samples was significantly higher than that in normal liver tissue; additionally, SAMD13 was higher in primary tumors, various stages of cancer and grades of tumor, and status of nodal metastasis. Higher SAMD13 expression was also associated with poorer prognosis. SAMD13 expression positively correlated with CD8+ T cells, CD4+ T cells, B cells, neutrophils, macrophages, and dendritic cells. In the analysis of SAMD13 co-expression networks, positively related genes of SAMD13 were associated with a high hazard ratio in different types of cancer, including HCC. In biological function of SAMD13, SAMD13 mainly include spliceosome, ribosome biogenesis in eukaryote, ribosome, etc. These results suggest that SAMD13 may serve as a novel prognostic biomarker for HCC diagnosis and provide novel insights into tumor immunology in HCC.
#Hepatocellular carcinoma #SAMD13 #Prognosis #Biomarker #Immune cells

목차

INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSION
REFERENCES

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