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자료유형
학술저널
저자정보
Serpen Durnaoglu (Hanyang University) 김희수 (부산대학교) Joohong Ahnn (Hanyang University) 이선경 (한양대학교)
저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제53권 제10호
발행연도
2020.1
수록면
521 - 526 (6page)

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Endogenous retroviruses (ERVs) are retrotransposons present in various metazoan genomes and have been implicated in metazoan evolution as well as in nematodes and humans. The long terminal repeat (LTR) retrotransposons contain several regulatory sequences including promoters and enhancers that regulate endogenous gene expression and thereby control organismal development and response to environmental change. ERVs including the LTR retrotransposons constitute 8% of the human genome and less than 0.6% of the Caenorhabditis elegans (C. elegans) genome, a nematode genetic model system. To investigate the evolutionarily conserved mechanism behind the transcriptional activity of retrotransposons, we generated a transgenic worm model driving green fluorescent protein (GFP) expression using Human endogenous retroviruses (HERV)-K LTR as a promoter. The promoter activity of HERV-K LTR was robust and fluorescence was observed in various tissues throughout the developmental process. Interestingly, persistent GFP expression was specifically detected in the adult vulva muscle. Using deletion constructs, we found that the region from positions 675 to 868 containing the TATA box was necessary for promoter activity driving gene expression in the vulva. Interestingly, we found that the promoter activity of the LTR was dependent on che-1 transcription factor, a sensory neuron driver, and lin-15b, a negative regulator of RNAi and germline gene expression. These results suggest evolutionary conservation of the LTR retrotransposon activity in transcriptional regulation as well as the possibility of che-1 function in non-neuronal tissues.
#Caenorhabditis elegans #che-1 #HERV #lin-15b #Retrotransposon

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Craig NL / 2015 / Mobile DNA III / ASM Press :1051~1078 google schola Bessereau JL / 2006 / The C. elegans Research Community / WormBook google schola Subramanian RP / 2011 / Identification, characterization, and comparative genomic distribution of the HERV-K(HML-2)group of human endogenous retroviruses / Retrovirology 8:90 google schola Vargiu L / 2016 / Classification and characterization of human endogenous retroviruses; mosaic forms are common / Retrovirology 13:7 google schola 김희수 / 2012 / Genomic Impact, Chromosomal Distribution and Transcriptional Regulation of HERV Elements / Molecules and Cells 33(6):539~544 dbpia

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