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Comparison between DNA- and cDNA-based gut microbial community analyses using 16S rRNA gene sequences
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Comparison between DNA- and cDNA-based gut microbial community analyses using 16S rRNA gene sequences

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Hyejun Jo (Jeju National University) Jiwan Hong (Jeju National University) Tatsuya Unno (Jeju National University)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제55권 제3호 KCI등재 SCOPUS
발행연도
2019.9
수록면
220 - 225 (6page)

이용수

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연구방법
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연구결과
Comparison between DNA- and cDNA-based gut microbial community analyses using 16S rRNA gene sequences
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최근 10년간 미생물생태분석 기반의 연구는 차세대염기서 열분석법이 개발된 이래로 지속적으로 증가하고 있다. 장내미생물생태와 건강의 연관성은 미생물 생태학 분야에 있어서 중요한 결과로 여겨지고 있다. 미생물 군집 분석은 주로 16SrRNA 유전자 가변 영역의 염기서열을 통해 분석되지만 이는 미생물의 활성 정보를 제공하지 않는다. 본 연구에서는 cDNA 기반의 미생물 생태분석을 수행하고 DNA 및 cDNA기반의 미생물생태분석 결과를 비교하였다. 두 가지의 서로 다른 접근법이 Butyrate producer와 probiotics와 같이 장내 대사과정에서 중요한 미생물의 abundance 뿐만 아니라 비만 지표로 알려진 Firmicutes 와 Bacteroidetes의 비율에 있어서 차이가 있음을 나타내었다. 따라서, cDNA 기반 미생물 군집은 이전에 수행된DNA 기반 미생물 군집 분석과 비교하여 장내미생물생태의 역할과 관련된 또 다른 분석 방향성을 제공한다.

목차

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Results and Discussion
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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2020-475-000448241