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해양무척추동물의 일부인 극피동물은 수관계라고 불리는 특유의 세관계로 순환계와 호흡계를 구성한다. 수관계 내부에는 해수와 체강액이 섞여 흐르고 있으며, 이러한 해수의 출입을 통해 다양한 해양미생물과 접촉하며 공생 관계를 가진다고 알려져 있다. 극피동물에 속하는 성게는 국내 전연안에서 해조류를 먹고 서식하며, 갯녹음 현상의 원인이라고 알려져 있으나 관련된 생태학적 연구는 부족하다.
Operational taxonomic unit (OTU) 분석 방법을 기반으로 16S rRNA 유전자 염기서열을 분석하여 독도와 울릉도에 서식하고 있는 성게 여섯 마리의 장내 미생물 군집을 분석하였다. 문(phylum)과 속(genus) 수준의 분석 결과, 미분류군이 높은 비율로 존재하고 있어 성게의 장내에서 서식하는 난배양성 미생물의 존재를 예측할 수 있었으며, 울릉도에서 서식하던 성게에서는 황 화합물과 산화된 질소를 이용할 수 있는 Sulfurospirillum 속이 높은 비율로 존재하였다. Beta-diversity (PCoA와 UPGMA) 분석 결과, 성게의 장내 미생물 군집이 서식지역에 따라 그룹화를 이루고 있음을 확인하였다. 또한 추가적으로 amplicon sequence variant (ASV) 분석 방법을 이용하여 성게의 장내 미생물 군집을 분석 및 비교한 결과, OTU 분석 방법의 다양성 지수값과 유사한 경향을 보였다. 본 연구를 통하여 성게 장내 미생물의 다양성과 군집 구조를 확인할 수 있었다.
Operational taxonomic unit (OTU) 분석 방법을 기반으로 16S rRNA 유전자 염기서열을 분석하여 독도와 울릉도에 서식하고 있는 성게 여섯 마리의 장내 미생물 군집을 분석하였다. 문(phylum)과 속(genus) 수준의 분석 결과, 미분류군이 높은 비율로 존재하고 있어 성게의 장내에서 서식하는 난배양성 미생물의 존재를 예측할 수 있었으며, 울릉도에서 서식하던 성게에서는 황 화합물과 산화된 질소를 이용할 수 있는 Sulfurospirillum 속이 높은 비율로 존재하였다. Beta-diversity (PCoA와 UPGMA) 분석 결과, 성게의 장내 미생물 군집이 서식지역에 따라 그룹화를 이루고 있음을 확인하였다. 또한 추가적으로 amplicon sequence variant (ASV) 분석 방법을 이용하여 성게의 장내 미생물 군집을 분석 및 비교한 결과, OTU 분석 방법의 다양성 지수값과 유사한 경향을 보였다. 본 연구를 통하여 성게 장내 미생물의 다양성과 군집 구조를 확인할 수 있었다.
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References
참고문헌 (40)
참고문헌 신청
Bennett KW and Eley A. 1993. Fusobacteria: new taxonomy and related diseases. J. Med. Microbiol. 39, 246–254.
Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK, Fierer N, Peña AG, Goodrich JK, Gordon JI, et al. 2010. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data. Nat. Methods 7, 335–336.
Chalifour B and Li J. 2021. Characterization of the gut microbiome in wild rocky mountainsnails (Oreohelix strigosa). Anim. Microbiome 3, 49.
Chen CY, Chen PC, Weng FC, Shaw GT, and Wang D. 2017. Habitat and indigenous gut microbes contribute to the plasticity of gut microbiome in oriental river prawn during rapid environmental change. PLoS ONE 12, e0181427.
Chudasama NA, Sequeira RA, Moradiya K, and Prasad K. 2021. Seaweed polysaccharide based products and materials: an assessment on their production from a sustainability point of view. Molecules 26, 2608.
Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, Costello EK, Fierer N, Peña AG, Goodrich JK, Gordon JI, et al. 2010. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data. Nat. Methods 7, 335–336.
Chalifour B and Li J. 2021. Characterization of the gut microbiome in wild rocky mountainsnails (Oreohelix strigosa). Anim. Microbiome 3, 49.
Chen CY, Chen PC, Weng FC, Shaw GT, and Wang D. 2017. Habitat and indigenous gut microbes contribute to the plasticity of gut microbiome in oriental river prawn during rapid environmental change. PLoS ONE 12, e0181427.
Chudasama NA, Sequeira RA, Moradiya K, and Prasad K. 2021. Seaweed polysaccharide based products and materials: an assessment on their production from a sustainability point of view. Molecules 26, 2608.
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