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자료유형
학술저널
저자정보
Jinyoung Bae (Catholic University of Pusan) Kyung Eun Lee (Catholic University of Pusan) Hyunwoo Jin (Catholic University of Pusan)
저널정보
대한의생명과학회 대한의생명과학회지 대한의생명과학회지 제25권 제4호
발행연도
2019.12
수록면
407 - 416 (10page)

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Recent years have seen an increase in the incidence of candidiasis caused by non-albicans Candida (NAC) species. In fact, C. glabrata is now second only to C. albicans as the most common cause of invasive candidiasis. Therefore, the rapid genotyping specifically for C. glabrata is required for early diagnosis and treatment of candidiasis. A number of genotyping assays have been developed to differentiate C. glabrata sequence types (STs), but they have several limitations. In the previous study, multi-locus sequence typing (MLST) has performed with a total of 101 C. glabrata clinical isolates to analyze the prevalent C. glabrata STs in Korea. A total of 11 different C. glabrata STs were identified and, among them, ST-138 was the most commonly classified. Thus, a novel probe-based quantitative PCR (qPCR) assay was developed and evaluated for rapid and accurate identification of the predominant C. glabrata ST-138 in Korea. Two primer pairs and hybridization probe sets were designed for the amplification of internal transcribed spacer 1 (ITS1) region and TRP1 gene. Analytical sensitivity of the probe-based qPCR assay was 100 ng to 10 pg and 100 ng to 100 pg (per 1 μL), which target ITS1 region and TRP1 gene, respectively. This assay did not react with any other Candida species and bacteria except C. glabrata. Of the 101 clinical isolates, 99 cases (98%) were concordant with MLST results. This novel probebased qPCR assay proved to be rapid, sensitive, highly specific, reproducible, and cost-effective than other genotyping assay for C. glabrata ST-138 identification.
#Candida glabrata #Genotyping #Quantitative PCR (qPCR) #Sequence types (STs) #TRP1

목차

INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSION
REFERENCES

참고문헌 (32)

참고문헌 신청
Abbes S / 2010 / A review of molecular techniques to type Candida glabrata isolates / Mycoses 53:463~467 google schola Abbes S / 2012 / Candida glabrata strain relatedness by new microsatellite markers / Eur J Clin Microbiol Infect Dis 31:83~91 google schola Becker K / 2000 / Molecular genotyping of Candida species with special respect to Candida (Torulopsis) glabrata strains by arbitrarily primed PCR / J Med Microbiol 49:575~581 google schola Berila N / 2010 / Molecular analysis of Candida glabrata clinical isolates / Mycopathologia 170:99~105 google schola Bineshian F / 2015 / Identification of Candida Species Using MP65 Gene and Evaluation of the Candida albicans MP65 Gene Expression in BALB/C Mice / Jundishapur J Microbiol 8:e18984 google schola

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