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학술저널
저자정보
Min-Ji Kang (Catholic University of Pusan) Yoon-Sung Choi (Catholic University of Pusan) Sunghyun Kim (Catholic University of Pusan)
저널정보
대한의생명과학회 대한의생명과학회지 대한의생명과학회지 제24권 제4호
발행연도
2018.12
수록면
430 - 434 (5page)

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Candida glabrata is the second most prevalent causative agent for candidiasis following C. albicans. The opportunistic yeast, C. glabrata, is able to cause the critical bloodstream infections in hospitalized patients. Conventional identification methods for yeasts are often time consuming and labor intensive. Therefore, recent studies on sequence-based identification have been conducted. Recently, sequencing the D1/D2 domain of the large subunit ribosomal RNA gene and the internal transcribed spacers (ITS) 1 and ITS2 regions of the ribosomal DNA has proven useful for DNA-based identification of most species of fungi. In the present study, therefore, fungal ITS and D1/D2 domain regions were targeted and analyzed by DNA sequencing for the accurate identification of C. glabrata clinical isolates. A total of 102 C. glabrata clinical isolates from various clinical samples including bloodstream, catheterized urine, bile and other body fluids were used in the study. The results of the DNA sequence analysis showed that the mean standard deviation of species identity percent score between ITS and D1/D2 domain regions was 97.8% ± 2.9 and 99.7% ± 0.46, respectively. These results revealed that the D1/D2 domain region might be a better target for identifying C. glabrata clinical isolates based on DNA sequences than the ITS1 and ITS2 regions. However, in order to evaluate the usefulness of D1/D2 domain region for species identification of all Candida species, other Candida species such as C. albicans, C. tropicalis, C. dubliniensis, and C. krusei should be verified in further studies additionally.
#Candida glabrata #Sequence analysis #D1/D2 domain #Internal transcribed spacers domain #Clinical isolates

목차

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참고문헌 (8)

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[학술지(정기간행물)] - Amanloo S / 2018 / Genotyping of Clinical Isolates of Candida glabrata from Iran by Multilocus Sequence Typing and Determination of Population Structure and Drug Resistance Profile / Med Mycol 56 : 207 ~ 215 google schola [학술지(정기간행물)] - Byun SA / 2018 / Multilocus Sequence Typing (MLST) Genotypes of Candida glabrata Bloodstream Isolatesin Korea: Association with Antifungal Resistance, Mutations in Mismatch Repair Gene (Msh2), and Clinical Outcomes / Front Microbiol 9 : 1 ~ 10 google schola [학술지(정기간행물)] - Da Silva-Rocha WP / 2014 / Candida species distribution, genotyping and virulence factors of Candida albicans isolated from the oral cavity of kidney transplant recipients of two geographic regions of Brazil / BMC Oral Health 14 : 20 ~ 28 google schola [학술지(정기간행물)] - Garner CD / 2010 / Molecular Identification of Veterinary Yeast Isolates by Use of Sequence-based Analysis of the D1/D2 Region of the Large Ribosomal Subunit / J Clin Microbiol 48 : 2140 ~ 2146 google schola [학술지(정기간행물)] - Hesham AEL / 2014 / Phylogenetic Analysis of Isolated Biofuel Yeasts Based on 5.8 S-ITS rDNA and D1/D2 26S rDNA Sequences / J Genet Engineer Biotech 12 : 37 ~ 43 google schola

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2019-510-000302707