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Three-dimensional(3D) structure of specific DNA can be changed between two conformations under an external environmental transition such as pH and salt concentration variations. We have experimentally observed the conformational transitions of i-motif DNA using AFM cantilever bioassay. It is shown that pH change of a solvent induces the bending defleciton change of a cantilever functionalized by i-motif DNA. This indicates that cantilever bioassay enables the label- free detection of DNA structural changes upon pH change. It is implied that cantilever bioassay can be a de novo route to quantitatively understand the conformational transitions of biological molecules under environmental changes.
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참고문헌 (27)
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C. D. Mao / 1999 / Designed two-dimensional DNA holliday junctio arrays visualized by atomic force microscopy / J. Am. Chem. Soc 121 : 5437 ~ 5443
D. Miyoshi / 2009 / Structural polymorphism of telomeric DNA regulated by pH and divalent cation / Nucleosides & Nucleic acid 22 : 203 ~ 221
E. Winfree / 1998 / Design and self-assembly of two-dimensional DNA crystals / Nature 394 : 539 ~ 544
H. Liu / 2007 / Light-driven conformational switch of i-motif DNA / Angew. Chem., Int. Ed 46 : 2515 ~ 2517
H. Yan / 2003 / DNA-templated self-assembly of protein arrays and highly conductive nanowires / Science 301 : 1882 ~ 1884
D. Miyoshi / 2009 / Structural polymorphism of telomeric DNA regulated by pH and divalent cation / Nucleosides & Nucleic acid 22 : 203 ~ 221
E. Winfree / 1998 / Design and self-assembly of two-dimensional DNA crystals / Nature 394 : 539 ~ 544
H. Liu / 2007 / Light-driven conformational switch of i-motif DNA / Angew. Chem., Int. Ed 46 : 2515 ~ 2517
H. Yan / 2003 / DNA-templated self-assembly of protein arrays and highly conductive nanowires / Science 301 : 1882 ~ 1884
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