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This report provides the complete nucleotidesequences of the full-length cDNA encoding squalene synthase(SQS) and its genomic DNA sequence from a triterpene-producingfungus, Ganoderma lucidum. The cDNA of the squalenesynthase (SQS) (GenBank Accesion Number: DQ494674)was found to contain an open reading frame (ORF) of 1,404 bpencoding a 468-amino-acid polypeptide, whereas the SQS genomicDNA sequence (GenBank Acesion Number: DQ494675)consisted of 1,984 bp and contained four exons and threG. lucidumgenome. The deduced amino acid sequence of Ganodermalucidum squalene synthase (Gl-SQS) exhibited a high homologywith other fungal squalene synthase genes and contained sixconserved domains. A phylogenetic analysis revealed that G.lucidum SQS belonged to the fungi SQS group, and was moreclosely related to the SQS of U. maydis than to those of otherfungi. A gene expression analysis showed that the expressionincreased after 14 to 20 days of incubation, and reached arelatively high level in the mushroom primordia. Functionalcomplementation of Gl-SQS in a SQS-deficient strain ofSaccharomyces cerevisiae confirmed that the cloned cDNAencoded a squalene synthase.

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