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논문 기본 정보

자료유형
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저널정보
대한임상미생물학회 Annals of Clinical Microbiology Annals of Clinical Microbiology 제9권 제1호
발행연도
2006.1
수록면
64 - 70 (7page)

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Background: Rapid detection of pathogens in blood is important in patient management, because the mortality rate associated with bloodstream infections is very high. We evaluated the efficiency of a 16S rDNA PCR assay for the detection of various pathogens in blood culture broth in a clinical laboratory. Methods: 16S rDNA PCR was performed on 221 blood culture bottles consisting of 99 culturepositive and 122 culture-negative samples. The results were compared with conventional culture methods. We also compared the efficiency of three DNA extraction and purification methods using proteinase K, triton X-100, and benzyl alcohol-guanidine DNA extraction of blood culture broths. Results: The 16S rDNA PCR method detected 95 (12 Staphylococcus aureus, 27 coagulase negative staphylococci, 10 enterococci, 5 streptococci, 37 gram negative bacilli, 4 corynebacteria) of 99 positive culture bottles. Four false-negative results were obtained for bottles containing 2 Corynebacterium, 1 Escherichia coli, and 1 S. aureus species. All 122 bottles that showed no blood culture growth were negative by 16S rDNA PCR. Overall, the sensitivity, specificity, positive predictive values and negative predictive values of 16S rDNA PCR relative to the culture results were 96.0%, 100%, 100%, and 96.8%, respectively. Among the three DNA extraction methods, the benzyl alcohol-guanidine method was most effective. Conclusion: The 16S rDNA PCR assay is a rapid and efficient means of detecting various pathogens in the blood and has great potential for use in the clinical microbiology laboratory.
#16S rDNA #Polymerase chain reaction #Blood culture #Sepsis

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참고문헌 (15)

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/ 1992 / Development of polymerase chain reaction primer sets for diagnosis of lyme disease and for species-specific identification of lyme disease isolates by 16S rRNA signa google schola / 1995 / Inhibition of PCR by aqueous and vitreous fluids 33 : 2643 ~ 2646 google schola / 1997 / Rapid identification of Candida species in blood cultures by a clinically useful PCR method 35 : 1454 ~ 1459 google schola / 1998 / Detection of bacteraemia in patients with fever and neutropenia using 16S rRNA geneamplification by polymerase chain reaction 17 : 247 ~ 253 google schola / 1998 / Improved amplification of microbial DNA from blood cultures by removal of the PCR inhibitor sodium polyanetholesulfonate 36 : 2810 ~ 2816 google schola

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