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저자정보
Yeo-Hyeon Kim (Sunchon National University) Sopheap Mao (Sunchon National University) Nihar Sahu (Sunchon National University) Uzzal Somaddar (Sunchon National University) Hoy-Taek Kim (Sunchon National University) Masao Watanabe (Tohoku University) Jong-In Park (Sunchon National University)
저널정보
한국식물병리학회 The Plant Pathology Journal The Plant Pathology Journal 제39권 제5호
발행연도
2023.10
수록면
494 - 505 (12page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2023

Molecular Marker Development for the Rapid Differentiation of Black Rot Causing Xanthomonas campestris pv. campestris Race 7
Yeo-Hyeon Kim ,  Sopheap Mao ,  Niha 외 6명 The Plant Pathology Journal 2023.10 학술저널

2022

Development of Molecular Marker for Detection of Xanthomonascampestris pv. campestris Race 7 in Brassicaceae
Yeo-Hyeon Kim ,  Sopheap Mao ,  Niha 외 6명 한국원예학회 학술발표요지 2022.11 학술대회자료

초록· 키워드

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Xanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) is a plant pathogen of Brassica crops that causes black rot disease throughout the world. At present, 11 physiological races of Xcc (races 1-11) have been reported. The conventional method of using differential cultivars for Xcc race detection is not accurate and it is laborious and time-consuming. Therefore, the development of specific molecular markers has been used as a substitute tool because it offers an accurate and reliable result, particularly a quick diagnosis of Xcc races. Previously, our laboratory has successfully developed race-specific molecular markers for Xcc races 1-6. In this study, specific molecular markers to identify Xcc race 7 have been developed. In the course of study, whole genome sequences of several Xcc races, X. campestris pv. incanae, X. campestris pv. raphani, and X. campestris pv. vesicatoria were aligned to identify variable regions like sequence-characterized amplified regions and insertions and deletions specific to race 7. Primer pairs were designed targeting these regions and validated against 22 samples. The polymerase chain reaction analysis revealed that three primer pairs specifically amplified the DNA fragment corresponding to race 7. The obtained finding clearly demonstrates the efficiency of the newly developed markers in accurately detecting Xcc race 7 among the other races. These results indicated that the newly developed marker can successfully and rapidly detect Xcc race 7 from other races. This study represents the first report on the successful development of specific molecular markers for Xcc race 7.
#Brassicaceae #black rot #marker #PCR #Xanthomonas campestris pv. campestris

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