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저자정보
Lee Cherl-Joon (Dankook University) Shin Wonseok (Dankook University Hospital) Mun Seyoung (Dankook University) Yu Minjae (DKU-Theragen institute for NGS analysis (DTiNa)) Choi Young-Bong (Dankook University) 김동희 (단국대학교) 한규동 (단국대학교)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.43 No.11
발행연도
2021.11
수록면
1,277 - 1,288 (12page)
DOI
10.1007/s13258-021-01162-4

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Background Coronavirus disease of 2019 (COVID-19) is well known as a fatal disease, frst discovered at Wuhan in China, ranging from mild to death, such as shortness of breath and fever. Early diagnosis of COVID-19 is a crucial point in preventing global prevalence. Objective We aimed to evaluate the diagnostic competency and efciency with the Allplex™ 2019-nCoV Assay kit and the Dr. PCR 20 K COVID-19 Detection kit, designed based on the qRT-PCR and dPCR technologies, respectively. Methods A total of 30 negative and 20 COVID-19 positive specimens were assigned to the diagnostic test by using different COVID-19 diagnosis kits. Diagnostic accuracy was measured by statistical testing with sensitivity, specifcity, and co-efciency calculations. Results Comparing both diagnostic kits, we confrmed that the diagnostic results of 30 negative and 20 positive cases were the same pre-diagnostic results. The diagnostic statistics test results were perfectly matched with value (1). Cohen’s Kappa coefcient was demonstrated that the given kits in two diferent ways were “almost perfect” with value (1). In evaluating the detection capability, the dilutional linearity experiments substantiate that the Dr. PCR 20 K COVID-19 Detection kit could detect SARS-CoV-2 viral load at a concentration ten times lower than that of the Allplex™ 2019-nCoV Assay kit. Conclusions In this study, we propose that the dPCR diagnosis using LOAA dPCR could be a powerful method for COVID19 point-of-care tests requiring immediate diagnosis in a limited time and space through the advantages of relatively low sample concentration and small equipment size compared to conventional qRT-PCR.
#Coronavirus disease of 2019 #Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 #quantitative real-time PCR #Digital PCR

목차

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Ambrosi C / 2021 / SARS-CoV-2 : comparative analysis of diferent RNA extraction methods / J Virol Methods 287:114008 google schola Cao L / 2017 / Advances in digital polymerase chain reaction(dPCR)and its emerging biomedical applications / Biosens Bioelectron 90:459~474 google schola Cascella M / 2021 / StatPearls google schola Chung YS / 2021 / Validation of real-time RT-PCR for detection of SARS-CoV-2 in the early stages of the COVID-19 outbreak in the Republic of Korea / Sci Rep 11:14817 google schola Czodrowski P / 2014 / Count on kappa / J Comput Aided Mol Des 28:1049~1055 google schola

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