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Pseudomonadota 문, Vibrionales 목에 속하는 Photobacterium 속은 그람 음성, 통성 호기성 및 운동성을 지닌 것으로 알려져 있다. 또한, 병원균을 포함한 Photobacterium 속 세균들은 다양한 생활사를 가지고 있다. 본 연구에서는 제주의 해양 퇴적물에서 Photobacterium 속의 GJH2-4 균주를 분리하여 완전한 게놈 서열을 분석하였다. 균주의 유전체 염기서열은 새로이(de novo) 조립되어, 총 3개의 완전 전장유전체가 확인되었으며, 전체 게놈 크기와 G + C 함량은 각각 약 5.41 Mb와 53.0%였다. 3개의 완전 전장유전체는, 4,794개의 단백질을 암호화하는 서열을 비롯하여, 34개의 리보솜 RNA, 153개의 운반 RNA 유전자가 확인되었다. 유전체 분석 결과, GJH2-4 균주의 게놈은 벤젠 분해, 완전 탈질화, 이화적 질산염 환원, 동화적 황산염 환원, 편모 조립과 다양한 비타민 생합성과 관련된 유전자를 지니고 있다. 또한, 저산소 조건에서 높은 산소 친화력을 가지는 cbb₃ 타입의 시토크롬 산화효소를 암호화하고 있다. 본 연구를 통하여, GJH2-4균주가 물질 순환에 기여하는 것을 발견하였으며, 이는 Photobacterium 속에 속하는 세균의 보다 다양한 능력에 대한 이해에 도움이 될 것이다.
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Angiuoli SV, Gussman A, Klimke W, Cochrane G, Field D, Garrity G, Kodira CD, Kyrpides N, Madupu R, Markowitz V, et al. 2008. Toward an online repository of standard operating procedures (SOPs) for (Meta)genomic annotation. OMICS 12, 137–141.
Beijerinck MW. 1889. Le Photobacterium luminosum, bactérie lumineuse de la mer de nord. Arch. Neerl. Sci. 23, 401–415.
Cohn F. 1878. Lettter to J. Penn which describes Micrococcus phosphoreum. Versameling van Stucken Betreffende het Geneeskundig Staats Toerzich. 126–130.
DasSarma S and DasSarma P. 2015. Halophiles and their enzymes: negativity put to good use. Curr. Opin. Microbiol. 25, 120–126.
Herbert RA. 1999. Nitrogen cycling in coastal marine ecosystems. FEMS Microbiol. Rev. 23, 563–590.
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