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Parasphingopyxis 속에 속하는 신종 해양 세균은 대한민국 추자도의 해수로부터 분리되었으며 CP4 균주로 명명하였다. 이 연구에서는 PacBio RS II와 Illumina HiSeq platforms을 사용하여 Parasphingopyxis sp. CP4의 유전체 분석을 수행하였다. 이 균주의 유전체는 58.55 mol% G + C 함량과 2,963,413bp 크기를 가진 1개의 염색체로 구성되어 있다. 또한, 2,867개의 단백질 암호화 염기 서열, 3개의 rRNA 유전자, 44개의 tRNA 유전자, 4개의 비암호화 RNA 유전자 및 9개의 위 유전자를 포함한다. CP4 균주의 유전체에는 약학의 임상 연구와 식품업 분야에서 응용할 수 있는 아스파라기나제 유전자가 존재하는 것으로 나타났다.
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Balkwill DL, Fredrickson JK, and Romine MF. 2006. Sphingomonas and related genera, pp. 605?629. In Dworkin M, Falkow S , Rosenberg E, Schleifer KH, and Stackbrandt E. (eds.), The Prokaryotes. Springer, New York, USA.
Jensen LJ, Julien P, Kuhn M, Mering CV, Muller J, Doerks T, and Bork P. 2008. eggNOG: automated construction and annotation of orthologous groups of genes. Nucleic Acids Res. 36, D250? D254.
Jeong SE, Kim KH, Baek K, and Jeon CO. 2017. Parasphingopyxis algicola sp. nov., isolated from a marine red alga Asparagopsis taxiformis and emended description of the genus Parasphingopyxis Uchida et al. 2012. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67, 3877?3881.
Kanehisa M, Sato Y, and Morishima K. 2016. BlastKOALA and GhostKOALA: KEGG tools for functional characterization of genome and metagenome sequences. J. Mol. Biol. 428, 726?731.
Kosako Y, Yabuuchi E, Naka T, Fujiwara N, and Kobayashi K. 2000. Proposal of Sphingomonadaceae fam. nov., consisting of Sphingomonas Yabuuchi et al. 1990, Erythrobacter Shiba and Shimidu 1982, Erythromicrobium Yurkov et al. 1994, Porphyrobacter Fuerst et al. 1993, Zymomonas Kluyver and van Niel 1936, and Sandaracinobacter Yurkov et al. 1997, with the type genus Sphingomonas Yabuuchi et al. 1990. Microbiol. Immunol. 44, 563?575.
Jensen LJ, Julien P, Kuhn M, Mering CV, Muller J, Doerks T, and Bork P. 2008. eggNOG: automated construction and annotation of orthologous groups of genes. Nucleic Acids Res. 36, D250? D254.
Jeong SE, Kim KH, Baek K, and Jeon CO. 2017. Parasphingopyxis algicola sp. nov., isolated from a marine red alga Asparagopsis taxiformis and emended description of the genus Parasphingopyxis Uchida et al. 2012. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67, 3877?3881.
Kanehisa M, Sato Y, and Morishima K. 2016. BlastKOALA and GhostKOALA: KEGG tools for functional characterization of genome and metagenome sequences. J. Mol. Biol. 428, 726?731.
Kosako Y, Yabuuchi E, Naka T, Fujiwara N, and Kobayashi K. 2000. Proposal of Sphingomonadaceae fam. nov., consisting of Sphingomonas Yabuuchi et al. 1990, Erythrobacter Shiba and Shimidu 1982, Erythromicrobium Yurkov et al. 1994, Porphyrobacter Fuerst et al. 1993, Zymomonas Kluyver and van Niel 1936, and Sandaracinobacter Yurkov et al. 1997, with the type genus Sphingomonas Yabuuchi et al. 1990. Microbiol. Immunol. 44, 563?575.
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