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저자정보
김혜란 (국립축산과학원 영양생리팀) 이지웅 (전남대학교) 고민정 (농촌진흥청 국립축산과학원) 박종은 (국립축산과학원) 김민지 (국립축산과학원) 백열창 (국립축산과학원) 박설화 (국립축산과학원) 임다정 (국립축산과학원) 이성대 (농촌진흥청) 최봉환 (농촌진흥청 국립축산과학원)
저널정보
경상대학교 농업생명과학연구원(구 경상대학교 시설원예연구소) 농업생명과학연구 농업생명과학연구 제54권 제4호
발행연도
2020.1
수록면
75 - 83 (9page)

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본 연구는 한우 개체식별 및 친자감별에 있어 기존의 di-nucleotide repeat microsatellite marker 사용 시 발생했던 stutter로 인한 대립유전자판별 오류 등의 문제들을 극복하고, 분석결과의 신뢰도와 정확도를 높이기 위해 tri-, tetra-, penta-, hexa-nucleotide repeat microsatellite 좌위들로이루어진 새로운 개체식별 마커 13 종(BTRC6_01, BTRC19_02, BTRC11_03, BTRC16_05, BTRC9_07, BPC19_08, BTEC17_09, BPC21_10, BTEC4_11, BPC7_12, BPC1_13, BHXC29_14, BPC1_15)을 개발하였다. 선발된 13개의 좌위를 가지고 소 1,530두에 microsatellite typing을실시한 결과, 총 61개에 대립유전자가 발견되었으며, 좌위별로 평균 4.69개의 대립유전자를 가지는 것으로 확인되었다. 마커의 다형성과 정보력의척도인 PIC (Polymorphism Information Contents)값은 0.25(BTRC9_07)~0.59(BTEC17_09)로 나타났으며 BHXC29_14, BPC1_13, BTEC17_09, BTRC16_05, BTRC19_02, BTRC6_01 좌위들은 PIC 0.5 이상 그리고 나머지 좌위들 모두 PIC 0.25 이상의 값을 가지는 것으로 확인되어마커로서 다형성이 있음이 검증되었다. 개발한 마커를 활용하여 한우(영암, 장흥)와 유럽우 7종 (Brown Swiss, Limousin, Angus, Simmental, Hereford, Charolais, Holstein)의 유전적 특성을 분석하였으며, 총 9개 집단의 Heterozygosity와 FIS (inbreeding coefficient) 값을 측정하였다. 기대이형접합율은 0.451(BS)~0.605(AG) 범위 내로, 한우는 0.532(영암), 0.545(장흥)의 값을 가지는 것으로 나타났다. 한우(영암, 한우)와 7종의유럽우들 간의 유연관계 분석은 특정 대립유전자 빈도를 근거로 한 유전적 거리의 추정으로 이루어졌다. 한우집단과 Simmental 간의 유전적거리(0.1848)가 가장 가깝고 비교적으로 Brown Swiss와의 유전적 분포(0.3352)가 가장 먼 것으로 나타났으며, 계통발생학적으로 유전적 분화양상을 확인함으로써 본 마커의 한우 유전적 다양성 및 유연관계 분석에 활용 가능성을 제시하였다.
#개체식별 #다형성 #유전적 다양성 #초위성체 마커 #한우

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참고문헌 (21)

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Bacher JW / 1998 / Penta Nucleotide repeats: Highly polymorphic genetic markers displaying minimal stutter / Artifact Proceedings from the Ninth International Symposium on Human Identification google schola Barendse W / 1993 / A genetic map of DNA loci bovine chromosome 1 / Genomics 18:602~608 google schola Barker JSF / 1994 / A global protocol for determining genetic distances among domestic livestock breeds / Proc. 5th World Congr. Genet. Appl. Livest. Prod 21:501~508 google schola Benson G / 1999 / Tandem repeats finder : A program to analyze DNA sequences / Nucleic Acids Res 27:573~580 google schola Botstein D / 1980 / Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms / Am. J. Hum. Genet 32:314~331 google schola

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