mtDNA D-loop 서열에 기초한 백한우의 유전적 다양성 및 Haplogroup 분류

김재환; 진대혁; 이재영; 김승창

doi:https://doi.org/10.14397/jals.2021.55.6.59

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저자정보: 김재환 (농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자원센터) 진대혁 (농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자센터) 이재영 (농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자원센터) 김승창 (농촌진흥청 국립축산과학원 가축유전자원센터)

저널정보: 경상대학교 농업생명과학연구원(구 경상대학교 시설원예연구소) 농업생명과학연구 농업생명과학연구 제55권 제6호

발행연도: 2021.12

수록면: 59 - 64 (6page)

DOI: https://doi.org/10.14397/jals.2021.55.6.59

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백한우는 한우에서 유래되었으며, 모색과 망막에 색소가 전혀 없는 전형적인 알비노 증상을 보인다. 본 연구는 mtDNA D-loop 영역 전체서열에 기초하여 백한우의 모계유전특성을 분석하기 위해 수행하였다. 백한우에서 특이적으로 나타나는 TYR 유전자 exon 2 영역의 염기변이를PCR-RFLP 분석을 통해 확인하였다. 이 결과를 통해서 본 연구에서 공시한 32두 모두 백한우임을 확인하였다. 백한우 32두에 대한 mtDNA D-loop 영역 전체 서열을 이용하여 염기변이 및 유전적 다양성을 확인하였다. A, T, C, G 염기 각각의 빈도는 32.8, 28.9, 24.4 및 13.9%, GC 함량은 38.3%로 확인되었으며, 이러한 빈도는 타 소품종들과 유사하였다. 또한 9개의 다형부위가 확인되었고, 6개의 haplotype으로 분류되었다. haplotype 다양성지수는 0.651, 염기변이율은 0.00181로 확인되었으며, 기존에 보고된 다른 소품종들보다 낮은 수치를 보였다. 염기변이 양상비교 및 계통유전학적 분석 결과, 백한우에서 나타난 6개의 haplotype은 T1 및 T3 haplogroup으로 분류되었으며, 특히 5개 haplotype이 T3 haplogroup에 포함되었다. 본 연구의 결과는 백한우의 보존, 관리 및 활용을 위한 중요한 자료로 활용될 수 있을 것으로 사료된다.

#백한우 #유전적 다양성 #D-loop #Haplogroup #mtDNA #D-loop #Genetic diversity #Haplogroup #mtDNA #White Hanwoo

참고문헌 (22)

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MAN Abdullah / 2012 / Genetic Characterization of the Aceh Cattle Using Phenotypic, Mitochondrial DNA of D-Loop Region and Microsatellite DNA Analyses / Reproduction in Domestic Animals 47:15~17

Wanda M. Blaszczyk / 2005 / A Tyrosinase missense mutation causes albinism in the Wistar rat / Pigment Cell Research 18(2):144~145

하이루 / 2012 / Effect of Population Reduction on mtDNA Diversity and Demographic History of Korean Cattle Populations / Animal Bioscience 25(9):1223~1228

C. Ginja / 2010 / Origins and genetic diversity of New World Creole cattle: inferences from mitochondrial and Y chromosome polymorphisms / Animal Genetics 41(2):128~141

Kristina Gvozdanović / 2019 / Genetic diversity of autochthonous pig breeds analyzed by microsatellite markers and mitochondrial DNA D-loop sequence polymorphism / Animal Biotechnology 30(3):242~251

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