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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Jin-Young Lee (Dankook University) Jae Young Rho (Dankook University)
저널정보
충남대학교 농업과학연구소 Korean Journal of Agricultural Science Korean Journal of Agricultural Science Vol.47 No.3
발행연도
2020.9
수록면
673 - 681 (9page)

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Human enteric Adenovirus 41 (HueAdV-41) is a major waterborne virus that causes human gastroenteritis and is classified as a viral group I double-strand DNA virus, Adenoviridae. HueAdV-41 has been detected with the polymerase chain reaction (PCR) in various samples such as ground water. However, the PCR-based diagnostic method has problems such as reaction time, sensitivity, and specificity. Thus, the loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay has emerged as an excellent method for field applications. In this study, we developed a LAMP system that can rapidly detect HueAdV-41 with high specificity and sensitivity. HueAdV-41 specific LAMP primer sets were tested through a specific, non-specific selection and sensitivity test for three prepared LAMP primer sets, of which only one primer set and optimum reaction temperature were selected. The developed LAMP primer set condition was confirmed as 63℃, and the sensitivity was 1 copy. In addition, to confirm the system, a LAMP positive reaction was developed with the restriction enzyme Taq I (T/GCC). The developed method in this study was more specific, rapid (typically within 2 - 3 hours), and highly sensitive than that of the conventional PCR method. To evaluate and verify the developed LAMP assay, an artificial infection test was done with five cDNAs from groundwater samples, and the results were compared to those of the conventional PCR method. We expect the developed LAMP primer set will be used to diagnose HueAdV-41 from various samples.
#Adenovirus-41 #human enteric Adenovirus #loop-mediated isothermal amplification (LAMP) #water sample

목차

Abstract
Introduction
Materials and Methods
Results and Discussion
Conclusion
References

참고문헌 (26)

참고문헌 신청
Allard A / 2001 / Rapid typing of human adenoviruses by a general PCR combined with restriction endonuclease analysis / Journal of Clinical Microbiology 39:498~505 google schola Banerjee A / 2017 / Molecular characterization of enteric adenovirus genotypes 40 and 41 identified in children with acute gastroenteritis in Kolkata, India during 2013-2014 / Journal of Medical Virology 89:606~614 google schola Berk AJ / 2013 / Fields virology / Lippincott Williams & Wikins :1704~1731 google schola Cheong S / 2009 / Enteric viruses in raw vegetables and groundwater used for irrigation in South Korea / Applied and Environmental Microbiology 75:7745~7751 google schola 조규봉 / 2018 / Construction of Improved PCR Primer Set for the Detection of Human Enteric Adenovirus 41 / 대한의생명과학회지 24(3):230~238 Crossref

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