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학술저널
저자정보
Lee, Hwa-Yong (Department of Forest Science, Chungbuk National University) Raveendar, Sebastin (National Agrobiodiversity Center, National Institute of Agricultural Science, RDA) An, Hyejin (Department of Industrial Plant Science and Technology, Chungbuk National University) Oh, Youn-Lee (Mushroom Science Division, National Institute of Horticultural and Herbal Science, RDA) Jang, Kab-Yeul (Mushroom Science Division, National Institute of Horticultural and Herbal Science, RDA) Kong, Won-Sik (Mushroom Science Division, National Institute of Horticultural and Herbal Science, RDA) Ryu, Hojin (Department of Biology, Chungbuk National University) So, Yoon-Sup (Department of Crop Science, Chungbuk National University) Chung, Jong-Wook (Department of Industrial Plant Science and Technology, Chungbuk National University)
저널정보
한국균학회 Mycobiology Mycobiology 제46권 제4호
발행연도
2018.1
수록면
421 - 428 (8page)

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The white button mushroom (Agaricus bisporus) is one of the most widely cultivated species of edible mushroom. Despite its economic importance, relatively little is known about the genetic diversity of this species. Illumina paired-end sequencing produced 43,871,558 clean reads and 69,174 contigs were generated from five offspring. These contigs were subsequently assembled into 57,594 unigenes. The unigenes were annotated with reference genome in which 6,559 unigenes were associated with clusters, indicating orthologous genes. Gene ontology classification assigned many unigenes. Based on genome data of the five offspring, 44 polymorphic simple sequence repeat (SSR) markers were developed. The major allele frequency ranged from 0.42 to 0.92. The number of genotypes and the number of alleles ranged from 1 to 4, and from 2 to 4, respectively. The observed heterozygosity and the expected heterozygosity ranged from 0.00 to 1.00, and from 0.15 to 0.64, respectively. The polymorphic information content value ranged from 0.14 to 0.57. The genetic distances and UPGMA clustering discriminated offspring strains. The SSR markers developed in this study can be applied in polymorphism analyses of button mushroom and for cultivar discrimination.
#Agaricus bisporus #button mushroom #SSR #illumina sequencing

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참고문헌 (8)

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Imbach EJ / 1946 / Mushroom of the canton of Lucerne and neighboring central Switzerland / Mitt Naturforsch Ges Luzern 15:1~85 google schola Morin E / 2012 / Genome sequence of the button mushroom Agaricus bisporus reveals mechanisms governing adaptation to a humic-rich ecological niche / Proc Natl Acad Sci U S A 109:17501~17506 google schola Liu J / 2013 / In vitro and in vivo antioxidant activity of ethanolic extract of white button mushroom(Agaricus bisporus) / Food Chem Toxicol 51:310~316 google schola Foulongne-Oriol M / 2009 / Novel microsatellite markers suitable for genetic studies in the white button mushroom Agaricus bisporus / Appl Microbiol Biotechnol 84:1125~1135 google schola McGee CF / 2018 / Microbial ecology of the Agaricus bisporus mushroom cropping process / Appl Microbiol Biotechnol 102:1075~1083 google schola

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