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학술저널
저자정보
Jin, Hoon (Medical Genomics Research Center) Kim, Seung-Ho (Instrumental Analysis Laboratory, KRIBB) Kim, Young-Uk (Medical Genomics Research Center) Park, Young-Kyu (Medical Genomics Research Center) Ji, Mi-Hyun (Medical Genomics Research Center) Kim, Young-Joo (Medical Genomics Research Center)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제6권 제2호
발행연도
2008.1
수록면
57 - 63 (7page)

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The Korean HapMap Project has been carried out for the last 5 years since it started in June, 2003. The project generated data for a sum of 1,764,000 Korean SNPs and formally registered the data to the dbSNP of NCBI (The dbSNP website. 2008). We have developed a series of software programs for association studies as well as for the comparison and analysis of Korean HapMap data with four other populations (CEPH, Yoruba, Han Chinese, and Japanese populations). The KHapmap Browser was developed and integrated to provide haplotype retrieval and comparative study tools of human ethnicities for comprehensive disease association studies (http://www.khapmap.org). On that basis, GBrowse was adopted in the KHapmap Browser for inherent Korean genetic data, and a provision of extended services was pledged with the distributed sequence annotation system (DAS). The dynamic linking service of the KHapmap Browser to other tools in our intranetwork environment provides many enhanced functions over GBrowse without DAS. KHapmap Browser is expected to be an invaluable tool for the study of Korean and international Hapmap data.
#Korean #SNP #browser #DAS #Hapmap #association

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Abecasis, G.R / 2001 / Extent and distribution of linkage disequilibrium in three genome regions / Am. J. Hum. Genet 68:191~197 google schola Barrett, J.C / 2005 / Haploview: analysis and visualization of LD and haplotype maps / Bioinformatics 21:263~265 google schola Berners-Lee, T / 2001 / The Semantic Web / Scientific American Magazine google schola Mungall, C.J / 2002 / An integrated computational pipeline and database to support whole-genome sequence annotation / Genome Biology 3:0081~0081 google schola Daly, M.J / 2001 / High resolution haplotype structure in the human genome / Nat. Genet 29:229~232 google schola

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