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Nam, Ky-Youb (Drug Discovery Division, Research Institute of Bioinformatics and Modelcular Design) Cho, Yong-Kee (Drug Discovery Division, Research Institute of Bioinformatics and Modelcular Design) Lee, Chang-Joon (Department of BioTechnology, Yonsei University) Shin, Jae-Hong (Drug Discovery Division, Research Institute of Bioinformatics and Modelcular Design) Choi, Jung-Won (Supercomputing Center, Korea Institute of Science and Technology Information) Gil, Joon-Min (Supercomputing Center, Korea Institute of Science and Technology Information) Park, Hark-Soo (Supercomputing Center, Korea Institute of Science and Technology Information) Hwang, Il-Sun (Supercomputing Center, Korea Institute of Science and Technology Information) No, Kyoung-Tai (Department of BioTechnology, Yonsei University)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 한국생물정보시스템생물학회 심포지엄 한국생물정보시스템생물학회 2004년도 The 3rd Annual Conference for The Korean Society for Bioinformatics Association of Asian Societies for Bioinformatics 2004 Symposium
발행연도
2004.1
수록면
181 - 190 (10page)

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The docking and in silico ligand screening procedures can select small sets of lead -like candidates from large libraries of either commercially or synthetically available compounds; however, the vast number of such molecules make the potential size of this task enormous. To accelerate the discovery of drugs to inhibit several targets, we have exploited massively distributed computing to screen compound libraries virtually. The Korea@HOME project was launched in Feb. 2002, and one year later, more than 1200 PC's have been recruited. This has created a 31 -gigaflop machine that has already provided more than 1400 hours of CPU time. It has all owed databases of millions of compounds to be screened against protein targets in a matter of days. Now, the virtual screening software suitable for distributed environments is developed by BMD. It has been evaluated in terms of the accuracy of the scoring function and the search algorithm for the correct binding mode.

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