Random amplified polymorphic DNA analysis of bacterial pathogens using universal rice primers

Sezim Monoldorova; 김진솔; 김준희; 전보영

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자료유형: 학술저널

저자정보: Sezim Monoldorova 김진솔 김준희 전보영

저널정보: 한국동물위생학회(구 한국가축위생학회) 한국가축위생학회지 한국가축위생학회지 제40권 제1호

발행연도: 2017.1

수록면: 1 - 6 (6page)

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Molecular typing of pathogenic microorganisms is important for epidemiological investigation of in-fectious disease outbreaks. In this study, we applied Universal Rice Primers (URP) that were originated from repetitive sequences in rice chromosomal DNA to random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis of pathogenic bacteria such as Escherichia coli, Listeria monocytogenes, and Salmonella sp. Of the twelve URP primers examined to date, seven primers (URP-2, -3, -4, -5, -6, -8, and -9) generated reproducible and polymorphic PCR products ranging from 1 to 13 bands. One of them, URP-6 was very effective in differentiating seven E. coli serotypes, seven L. monocytogenes clinical isolates, and eight Salmonella subspecies (ssp.) serovars. The results thus indicate that RAPD analysis using URP primers might be useful in typing bacterial pathogens including E. coli, L. monocytogenes, and Salmonella strains.

#RAPD analysis #URP primers #E. coli #Listeria monocytogenes #Salmonella

참고문헌 (16)

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Chen S1 / 2011 / Multiple-locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) of Listeria monocytogenes directly in food samples / Int J Food Microbiol 148 : 8 ~ 14

Franklin RB / 1999 / Characterization of microbial communities using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) / J Microbiol Methods 35 : 225 ~ 235

Grover A / 2016 / Development and use of molecular markers: past and present / Crit Rev Biotechnol 36 : 290 ~ 302

Hee-WanKang / 2002 / PCR Based Detection of Phellinus linteus using Specific Privers Generated from Universal Rice Primer (URP) Derived PCR Polymorphic Band / Mycobiology 30

Jana TK / 2005 / Genetic differentiation of charcoal rot pathogen, Macrophomina phaseolina, into specific groups using URP-PCR / Can J Microbiol 51 : 159 ~ 164

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이 논문의 저자 정보

Sezim Monoldorova

소속기관 Yonsei University Wonju

주요연구분야 의약학 > 수의학

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김진솔

소속기관 한국동물위생학회(구 한국가축위생학회)

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김준희

소속기관 한국동물위생학회(구 한국가축위생학회)

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전보영

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