Rapid detection and Quantification of Fish Killing Dinoflagellate  Cochlodinium polykrikoides (Dinophyceae) in Environmental  Samples Using Real-time PCR

박영태; 박태규; 강양순; 서미경; 김창훈

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자료유형: 학술저널

저자정보: 박영태 박태규 강양순 서미경 김창훈

저널정보: 한국수산과학회 Fisheries and Aquatic Sciences Fisheries and Aquatic Sciences 제11권 제4호

발행연도: 2008.1

수록면: 205 - 208 (4page)

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The mixotrophic dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides was reported to be linked to major fish kills in Korea and Japan since the 1990s. Rapid and sensitive detection of microalgae has been problematic because morphological identification of dinoflagellates requires light microscopic and scanning electron microscopic observations that are time consuming and laborious compared to real-time PCR. To address this issue, a real-time PCR probe targeting the ITS2 rRNA gene was used for rapid detection and quantification of C. polykrikoides. PCR inhibitors in water column samples were removed by dilution of template DNA for elimination of false-negative reactions. A strong association between cell quantification using real-time PCR and microscopic counts suggests that the real-time PCR assay is an alternative method for cell estimation of C. polykrikoides in environment samples.

#Cochlodinium polykrikoides #Harmful algal blooms #Real-time PCR #Red tide

참고문헌 (15)

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Guillard, R.R.L / 1962 / Studies of marine planktonic diatoms. ?. Cyclotella nana Hustedt and Detonula confervacea cleve / Canadian Journal of Microbiology 8 : 229 ~ 239

Hallegraeff, G.M / 2003 / Harmful algal blooms: a global overview / Manual on Harmful Marine Microalgae. IOC Manuals and Guides, UNESCO, New York : 25 ~ 50

Holland, P.M / 1991 / Detection of specific polymerase chain reaction products by utilizing the 5'-3' exonuclease activity of Thermus aquaticus DNA polymerase / Proceedings o

Iwataki, M / 2007 / Cochlodinium fulvescens sp. nov. (Gymnodiniales, Dinophyceae), a new chain-forming unarmored dinoflagellate from Asian coasts / Phycological Research 55 :

Iwataki, M / 2008 / Phylogenetic relationships in the harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides (Gymnodiniales, Dinophyceae) inferred from LSU rDNA sequences / Harmfu

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