Detection of Isoniazid and Rifampicin Resistance by Sequencing of katG, inhA, and rpoB Genes in Korea

조은해; 배혜경; 강성기; 이은희

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자료유형: 학술저널

저자정보: 조은해 배혜경 강성기 이은희

저널정보: 대한진단검사의학회 Annals of Laboratory Medicine Annals of Laboratory Medicine 제29권 제5호

발행연도: 2009.1

수록면: 455 - 460 (6page)

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Background : In Korea, tuberculosis is resistant to isoniazid (INH) and/or rifampicin (RIF) in more than 10% of cases. To prevent the spread of resistant Mycobacterium tuberculosis strains, it is crucial to develop more rapid resistance detection methods. Methods : To determine the feasibility of using direct sequencing for detecting INH- and RIF-resistant strains, the katG gene, the regulatory region of the inhA gene, and the 81-bp hot-spot region of the rpoB gene from 95 culture isolates and 46 respiratory specimens were sequenced. Total 141 culture isolates were classified by conventional drug susceptibility testing (DST) as INHR/RIFR (N=30),INHR/RIFS (N=23), INHS/RIFR (N=15), and INHS/RIFS (N=73). Results : Compared with phenotypic DST, the overall sensitivity and specificity of sequencing were 83.0% (44/53) and 96.6% (85/88), respectively, for INH resistance, and 93.3% (42/45) and 100% (96/96), respectively, for RIF resistance. The rates were similar between culture isolates and respiratory specimens. Interestingly, three specimens with inhA -15C>T mutation were susceptible to INH by conventional DST. Conclusions : Detection of mutations in the katG codon 315, the inhA regulatory region, and the hot-spot region of rpoB would be useful for rapid detection of INH and RIF resistance in Korea.

#Mycobacterium tuberculosis #inhA #katG #rpoB

참고문헌 (18)

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Abe C / 2008 / Biological and molecular characteristics of Mycobacterium tuberculosis clinical isolates with low-level resistance to isoniazid in Japan / J Clin Microbiol 46

Bai GH / 2007 / Trend of anti-tuberculosis drug resistance in Korea, 1994-2004 / Int J Tuberc Lung Dis 11 : 571 ~ 576

Banerjee A / 1994 / inhA, a gene encoding a target for isoniazid and ethionamide in Mycobacterium tuberculosis / Science 263 : 227 ~ 230

Bartfai Z / 2001 / Molecular characterization of rifampin-resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis from Hungary by DNA sequencing and the line probe assay / J Clin Mi

Coll P / 2005 / Molecular analysis of isoniazid and rifampin resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates recovered from Barcelona / Microb Drug Resist 11 : 107 ~ 114

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