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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제37권 제2호
발행연도
2010.1
수록면
196 - 204 (9page)

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With the completion of genome sequencing of several organisms, attention has been focused to determine the function and functional network of proteins by proteome analysis. The recent techniques of proteomics have been advanced quickly so that the high-throughput and systematic analyses of cellular proteins are enabled in combination with bioinformatics tools. Furthermore, the development of proteomic techniques helps to elucidate the functions of proteins under stress or diseased condition, resulting in the discovery of biomarkers responsible for the biological stimuli. Ultimate goal of proteomics orients toward the entire proteome of life, subcellular localization, biochemical activities, and their regulation. Comprehensive analysis strategies of proteomics can be classified as three categories: (i) protein separation by 2-dimensional gel electrophoresis (2-DE) or liquid chromatography (LC), (ii) protein identification by either Edman sequencing or mass spectrometry (MS),and (iii) quanitation of proteome. Currently MS-based proteomics turns shiftly from qualitative proteome analysis by 2-DE or 2D-LC coupled with off-line matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) and on-line electrospray ionization (ESI) MS, respectively, to quantitative proteome analysis. Some new techniques which include top-down mass spectrometry and tandem affinity purification have emerged. The in vitro quantitative proteomic techniques include differential gel electrophoresis with fluorescence dyes, protein-labeling tagging with isotope-coded affinity tag, and peptide-labeling tagging with isobaric tags for relative and absolute quantitation. In addition, stable isotope labeled amino acid can be in vivo labeled into live culture cells through metabolic incorporation. MS-based proteomics extends to detect the phosphopeptide mapping of biologically crucial protein known as one of post-translational modification. These complementary proteomic techniques contribute to not only the understanding of basic biological function but also the application to the applied sciences for industry.
#Chromatography #Gel electrophoresis #Mass spectrometry #Plant proteomics #Quantitative proteomics

목차

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Abu Hena Mostafa Kamal / 2009 / Diversity of Novel Glutenin Subunits in Bread google schola Aghaei K / 2009 / Proteome analysis of soybean hypocotyl and root under salt stress / Amino acids 36 : 91 ~ 98 google schola Anderson OD / 1989 / Nucleotide sequences of the two high-molecular weight glutenin genes from the D-genome of a hexaploid bread wheat, Triticum aestivum L. cv Cheyenne / Nuc google schola Anderson OD / 1989 / The characterization and comparative analysis of high-molecular-weight glutenin genes from genomes A and B of a hexaploid bread wheat / Theor Appl Genet google schola Bardi JS / / Scientists Identify Thousands of Proteins Associated with the Deadliest Form of Malaria / The scripps research institute 2 : 29 ~ google schola

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