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자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
거트앤리버 발행위원회 Gut and Liver Gut and Liver 제11권 제1호
발행연도
2017.1
수록면
112 - 120 (9page)

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Background/Aims: The integration of multiple profiling data and the construction of a transcriptional regulatory network may provide additional insights into the molecular mechanisms of hepatocellular carcinoma (HCC). The present study was conducted to investigate the deregulation of genes and the transcriptional regulatory network in HCC. Methods: An integrated analysis of HCC gene expression datasets was performed in Gene Expression Omnibus. Functional annotation of the differentially expression genes (DEGs) was conducted. Furthermore, transcription factors (TFs) were identified, and a global transcriptional regulatory network was constructed. Results: An integrated analysis of eight eligible gene expression profiles of HCC led to 1,835 DEGs. Consistent with the fact that the cell cycle is closely related to various tumors, the functional annotation revealed that genes involved in the cell cycle were significantly enriched. A transcriptional regulatory network was constructed using the 62 TFs, which consisted of 872 TF-target interactions between 56 TFs and 672 DEGs in the context of HCC. The top 10 TFs covering the most downstream DEGs were ZNF354C, NFATC2, ARID3A, BRCA1, ZNF263, FOXD1, GATA3, FOXO3, FOXL1, and NR4A2. This network will appeal to future investigators focusing on the development of HCC. Conclusions: The transcriptional regulatory network can provide additional information that is valuable in understanding the underlying molecular mechanism in hepatic tumorigenesis.
#Carcinoma #hepatocellular #Microarray dataset #Transcriptional regulatory network

목차

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참고문헌 (39)

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Liang J / 2015 / Identification of dysfunctional biological pathways and their synergistic mechanism in hepatocellular carcinoma process / Exp Mol Pathol 98:540~545 google schola Fu Z / 2008 / FOXOs, cancer and regulation of apoptosis / Oncogene 27:2312~2319 google schola Fei M / 2009 / Arsenic trioxide-induced growth arrest of human hepatocellular carcinoma cells involving FOXO3a expression and localization / Med Oncol 26:178~185 google schola Zhao X / 2015 / Threonine 32 (Thr32) of FoxO3 is critical for TGF-β-induced apoptosis via Bim in hepatocarcinoma cells / Protein Cell 6:127~138 google schola Frietze S / 2010 / Genomic targets of the KRAB and SCAN domain-containing zinc finger protein 263 / J Biol Chem 285:1393~1403 google schola

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