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논문 기본 정보

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저널정보
한국데이터정보과학회 한국데이터정보과학회지 한국데이터정보과학회지 제28권 제3호
발행연도
2017.5
수록면
597 - 604 (8page)

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본 연구는 홀스타인 젖소, 923두에 대한 단일염기다형성 (SNP) 42,201개를 이용하여 국내 젖소집단의 유전적 특성 및 유효집단크기를 조사하고자 실시하였다. 염색체별 인접 단일염기다형성간의 평균 연관불평형 (r<sup>2</sup>)은 0.22로 추정되었으며, 14번 염색체 (0.26)에서 가장 높은 반면 27번 염색체(0.17)에서 가장 낮게 나타났다. SNP간의 물리적 거리가 25Kb 미만인 경우에서 r<sup>2</sup>은 0.31±0.33으로 추정되었으며, SNP간 물리적 거리가 증가할수록 r<sup>2</sup>은 현저히 감소하였다. SNP간 물리적 거리가 2.5Mb 이상에서의 r<sup>2</sup>은 0.04로 25Kb 미만인 경우와 비교할 때 0.27 (87.1%) 감소하였다. 국내 홀스타인 젖소의 유효집단크기는 세대수와 비례하여 감소하는 경향을 나타내었으며, 1~5세대에서110두로 추정되었다.

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