식품으로부터 식중독 세균 검출을 위한 Real-time PCR에 적합한 DNA 추출 방법 비교

구은정; 김동호; 오세욱

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자료유형: 학술저널

저자정보: 구은정 (국민대학교) 김동호 (BMS) 오세욱 (국민대학교)

저널정보: 한국식품과학회 한국식품과학회지 한국식품과학회지 제48권 제4호

발행연도: 2016.8

수록면: 335 - 340 (6page)

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본 연구에서는 다양한 식품으로부터 식중독 세균의 DNA를 추출하는 효율을 비교 하였다. 사용된 DNA 추출 방법은 TaKaRa Kit를 이용하는 방법, PrepMan reagent를 이용하는 방법, boiling method, PEG를 이용한 alkaline method가 사용되었다. 비용절감이나 시간절약 면에서 boiling method나 PrepMan method도 고려할 수 있지만, column kit를 이용하는 TaKaRa kit가 효율적이라고 판단되었다. 또한 정성 시험법에서 적은 양의 균을 검출하기 위해 증균배양을 거치게 되는데 이때 사용되는 증균배지의 성분이 DNA 추출 후에도 잔류하여 saline과 비교하였을 때 DNA 추출효율이 낮은 결과를 나타내었다. 따라서 증균배지의 성분을 제거한 뒤 DNA를 추출하는 것이 PCR의 효율을 높일 수 있을 것으로 예상된다. 정량 시험법에서는 증균과정을 거치지 않아 균을 검출할 때 DNA의 추출 효율이 중요하기 때문에 DNA 추출 효율을 높이기 위한 가장 좋은 버퍼를 선정하고자 하였다. 그 결과 E. coli O157:H7에서는 saline이, S. aureus에서는 증류수를 버퍼로 사용했을 때 DNA 추출 효율이 가장 높은 것으로 나타났다.

#DNA isolation #real-time PCR #pathogens #detection

참고문헌 (23)

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[학술지(정기간행물)] - Padhye NV / 1992 / Escherichia coli O157: H7: Epidemiology, pathogenesis, and methods for detection in food / J. Food Protect 55 : 555 ~ 565

[학술지(정기간행물)] - Centers of Disease Control and Prevention / 1999 / Outbreak of Escherichia coli O157: H7 and Campylobacter among attendees of the Washington county fair-New york, 1999 / Morb. Mortal. Wkly Rep 48 : 803 ~ 805

[학술지(정기간행물)] - Eaton KA / 2008 / Pathogenesis of renal disease due to enterohemorrhagic Escherichia coli in germ-free mice / Infect. Immun 76 : 3054 ~ 3063

[학술지(정기간행물)] - Alarcon B / 2006 / PCR-based procedures for detection and quantification of Staphylococcus aureus and their application in food / J.Appl. Microbiol 100 : 352 ~ 364

[학술지(정기간행물)] - Valle J / 1990 / Enterotoxin production by staphylococci isolated from healthy goats / Appl. Environ. Microbiol 56 : 1323 ~ 1326

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