한국형 사람 Caliciviruses의 RNA - Dependent RNA Polymerase Diversity

한동표; 김지애; 양재명; 김경희

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자료유형: 학술저널

저자정보: 한동표 김지애 양재명 김경희

저널정보: 대한바이러스학회 JOURNAL OF BACTERIOLOGY AND VIROLOGY 大韓바이러스學會誌 제27권 제1호

발행연도: 1997.6

수록면: 1 - 8 (8page)

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Human caliciviruses (HuCVs) cause sporadic cases and outbreaks of acute gastroenteritis (AGE). Three major genogroups of HuCVs have been described including the Norwalk virus (NV)-, the Snow Mountain virus (SMA)-, and the Sapporo-genogroups. This study describes the detection and genetic variation of HuCVs from hospitalized infants with AGE in Korea by RT- PCR and sequencing. The cDNA fragments of 206 to 470bp corresponding to the region of 3 primer pairs (36/35, 35/51 or 3/51) in the polymerase region of NV were generated. Of 185 stools screened, 8% were positive by RT-PCR and their sequences showed that all strains contained the GLPSG and YGDD motifs which are conserved for HuCVs. Amino acid (aa) sequence analysis showed that these strains can be divided into 3 major genogroups. High conservation was observed in that one strain shares 100% of aa sequence with Southampton virus, another shares 99% with the Sapporo virus, and six strains share 90 to 95% with Snow Mountain virus. However, significant sequence variation was also found in other strains. This study indicates that all major genogroups of HuCVs are circulating in Korea.

#Caliciviruses #RNA polymerase #Genetic diversity

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