지원사업
학술연구/단체지원/교육 등 연구자 활동을 지속하도록 DBpia가 지원하고 있어요.
커뮤니티
연구자들이 자신의 연구와 전문성을 널리 알리고, 새로운 협력의 기회를 만들 수 있는 네트워킹 공간이에요.
초록· 키워드
오류제보하기
본 연구는 Prevotella nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP>에 대한 균주 특이 DNA 프로브라고 보고된 Pn10 프로브의 균주 특이성을 한국인에서 분리된 P. nigrescens의 임상분리 균주를 이용하여 검증하고, P. nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP> 균주특이 PCR 프라이머를 개발하고자 시행되었다. P. nigrescens와 유전학적으로 가장 가까운 Prevotella intermedia를 포함한 구강 내 치주질환 원인균종인 5균종의 표준균주 및 참고균주, 그리고 P. nigrescens와 P. intermedia의 임상분리 균주를 이용하여 Southern blot 분석법을 시행하였다. Southern blot 분석 결과 Pn10 DNA 프로브에 P. nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP> 및 ChDC KB6 두 균주 지놈 DNA가 검출되었다. P. nigrescens KB6 균주에서 Pn10 DNA프로브와 상동성이 있는 부위를 PCR법으로 증폭(KB6-Pn10)하여 클로닝한 다음 Pn10 DNA 프로브와 같이 핵산염기서열을 결정하여 상동성을 비교하였다. 그 결과 Pn10과 KB6-Pn10의 핵산염기서열간의 percent identity는 98.8%였으며, divergence는 0.6%였다. Pn10 DNA 프로브의 핵산염기서열을 바탕으로 두 종류 프라이머 쌍(Pn10-F-AC/ Pn10-R-AC 및 Pn10-F-A/ Pn10-R-A)을 설계 및 제작하여 P. nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP>에 대한 균주 특이성을 PCR법으로 검증하였다. 이들 프라이머 쌍들의 민감도(sensitivity) 조사 결과, 이들은 P. nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP> 지놈 DNA 4 pg까지 검출할 수 있음을 알았다. 이상의 연구 결과를 종합하면, Pn10 DNA 핵산염기서열을 바탕으로 설계된 Pn10-F-AC/ Pn10-R-AC 및 Pn10-F-A/ Pn10-R-A 프라이머 쌍들은 P. nigrescens ATCC 33563<SUP>T</SUP>를 신속 정확하게 검출하는 수 있어, 균주의 보존적 측면에서 유용하게 이용될 수 있을 것으로 생각된다.
목차
재료 및 방법
결과
고찰
감사의 말
참고문헌
ABSTRACT
참고문헌 (0)
참고문헌 신청함께 읽어보면 좋을 논문
논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!
-
프라이머 중합체를 이용한 원위치 중합효소 연쇄반응 In situ PCR 방법의 개발
미생물학회지
2004 .06
-
A Genome-Specific PCR Primer Design Program for Open Reading Frames
한국생물정보시스템생물학회 학술대회
2005 .01
-
핵산중합효소 연쇄반응에 의한 병리검체내 결핵균의 검출 Ⅰ. Primers선택과 반응조건
The Journal of the Korean Society for Microbiology
1992 .02
-
Pig6 DNA probe를 기반으로 하는 Prevotella intermedia ATCC 49046 균주-특이 PCR primer 개발
미생물학회지
2006 .06
-
Application of LATE-PCR to Detect Candida and Aspergillus Fungal Pathogens by a DNA Hybridization Assay
한국미생물·생명공학회지
2017 .01
-
Development of Broad-range and Specific 16S rRNA PCR for Use in Routine Diagnostic Clinical Microbiology
생명과학회지
2014 .04
-
핵산중합효소 연쇄반응에 의한 결핵균 검출을 위한 여러가지 Primer의 비교
The Journal of the Korean Society for Microbiology
1994 .06
-
국내 식물검역대상 Phytophthora pinifolia의 PCR 검출을 위한 종 특이적 마커 개발
한국균학회지
2016 .01
-
Quantification of trace DNA using real-time PCR and random primer
한국분석과학회 학술대회
2010 .11
-
Detection of Nocardia sp. H17-1 by PCR during Bioremediation ofCrude Oil-Contaminated Soil
한국미생물·생명공학회지
2004 .01
-
해조류로부터 Arbitrary 및 ITS Primer들을 사용한 직접 PCR 유전자 증폭반응의 한계 ( Limits of Direct PCR Amplification from Seaweeds Using Arbitrary and ITS Primers )
생명과학회지
1999 .02
-
PCR을 이용한 육류 내 Salmonella sp. 및 Salmonella Typhimurium 분리 검출
동아시아식생활학회지
2009 .04
-
PCR Based Detection of Phellinus linteus using Specific Primers Generated from Universal Rice Primer(URP) Derived PCR Polymorphic Band
Mycobiology
2002 .01
-
잿빛곰팡이병균(Botrytis cinerea)의 종 동정과 PCR 검출을 위한 종 특이적 Primer의 개발
한국균학회지
2008 .01
-
Development of probe and primer design system for detection of pathogenic bacteria
한국생명과학회 심포지움
2004 .10
-
Nested PCR과 DNA Enzyme-Linked Immunosorbent Assay를 이용한 Ralstonia solanacearum의 검출
미생물학회지
2007 .09
-
결핵균 검출을 위한 핵산중합효소 연쇄반응(PCR)에 유용한 Internal Control DNA
The Journal of the Korean Society for Microbiology
1995 .04
-
Optimization of primer sets and detection protocols for SARS-CoV-2 of coronavirus disease 2019 (COVID-19) using PCR and real-time PCR
Experimental and Molecular Medicine
2020 .01
이 논문의 저자 정보
이 논문과 함께 이용한 논문
DNA 직접추출법에 따른 산림토양 부식층 내 세균군집의 계통학적 다양성 비교
손희성
,
한송이
,
황경숙
미생물학회지
2007
.09
디지털 PCR을 응용한 특정 amoA 유전자를 가진 질산화 Archaea 동정
박병준
,
박수제
,
이성근
미생물학회지
2007
.09
구강 질환 유발 미생물에 대한 항생작용을 갖는 천연물 추출물 검색
백동헌
미생물학회지
2007
.09
단백질 분해효소를 분비하는 Micrococcus sp. HJ19의 분리 및 특성
차인태
,
오용식
,
노동현
미생물학회지
2007
.09
야생 효모의 분리ㆍ동정 및 이를 이용한 포도주 제조
김정인
,
이남근
,
함영태
미생물학회지
2007
.09
최근 본 자료
댓글(0)
0
UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2013-475-001681389