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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 제37권 제1호
- 발행연도
- 2010.1
- 수록면
- 74 - 79 (6page)
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단백질의 아미노산 조성은 생물정보학의 여러 문제를 해결하기 위한 기초적인 정보로 자주 활용된다. 본 논문에서는 아미노산간의 진화적인 연관성을 정의한 BLOSUM 행렬에서 유도한 유사도 함수를 사용하여 아미노산 조성을 결정한다. 이러한 방법은 생물학적인 연관성이 있는 단백질 서열일수록 비슷한 아미노산 조성을 갖도록 한다. 또한 단백질의 구조와 기능에 중요한 역할을 하는 위치-특이적인 아미노산의 분포를 추정하기 위해서 레이더나 음성 신호의 스펙트럼 분석에 사용되는 개념인 시간-종속 분석, 시간 해상도와 주파수 해상도의 개념을 적용하였다. 제안한 방법을 단백질의 세포내 위치예측에 적용하여 기존의 아미노산 조성 추정 방법을 사용하는 것보다 크게 향상된 성능을 보임을 확인하였다.
목차
요약
Abstract
1. 서론
2. 위치 종속 유사도 스펙트럼을 사용한 아미노산의 조성 추정
3. 실험 및 분석
4. 결론 및 향후연구
참고문헌
참고문헌 (14)
참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - M. A. Andrade / 1998 / Adaption of protein surfaces to subcellular location / J. Mol. Biol 276 : 517 ~ 525
2. [학술지(정기간행물)] - M. Paetzel / 2002 / Signal peptidases / Chem. Rev. 102 : 4549 ~ 4580
3. [학술지(정기간행물)] - V. Goder / 2003 / Molecular mechanism of signal sequence orientation in the endoplasmic reticulum / The EMBO Journal 22 : 3645 ~ 3653
4. [학술지(정기간행물)] - E. Granseth / 2005 / A study of the membrane-water interface region of membrane proteins / J. Mol. Biol. 346 : 377 ~ 385
5. [학술지(정기간행물)] - K.-J. Park / 2003 / Prediction of protein subcellular location by support vector machines using compositions of amino acids and amino acid pairs / Bioinformatics 19 : 1656 ~ 1663
2. [학술지(정기간행물)] - M. Paetzel / 2002 / Signal peptidases / Chem. Rev. 102 : 4549 ~ 4580
3. [학술지(정기간행물)] - V. Goder / 2003 / Molecular mechanism of signal sequence orientation in the endoplasmic reticulum / The EMBO Journal 22 : 3645 ~ 3653
4. [학술지(정기간행물)] - E. Granseth / 2005 / A study of the membrane-water interface region of membrane proteins / J. Mol. Biol. 346 : 377 ~ 385
5. [학술지(정기간행물)] - K.-J. Park / 2003 / Prediction of protein subcellular location by support vector machines using compositions of amino acids and amino acid pairs / Bioinformatics 19 : 1656 ~ 1663
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