단백질 상호작용 네트워크에서 필수 단백질의 견고성 분석

류제운; 강태호; 유재수; 김학용

추천

검색

질문

자료유형: 학술저널

저자정보: 류제운 강태호 유재수 김학용

저널정보: 한국콘텐츠학회 한국콘텐츠학회논문지 한국콘텐츠학회논문지 제8권 제6호

발행연도: 2008.6

수록면: 74 - 81 (8page)

이용수

📌

연구주제

📖

연구배경

🔬

연구방법

🏆

연구결과

초록· 키워드

오류제보하기

단백질 상호작용 네트워크는 허브(hub)라 할 수 있는 상호작용 수가 많은 소수의 단백질과 상호작용 수가 적은 다수의 단백질들로 구성된다. 최근 들어 여러 연구들에서 허브 단백질이 비 허브(non-hub) 단백질보다 상호작용 네트워크에 필수적인 단백질일 가능성이 높다고 보고되고 있다. 이러한 현상을 중심-치명 룰(centrality-lethality rule)이라 하는데, 이는 복잡계 네트워크에서 허브단백질의 중요성 및 네트워크 구조의 중요성을 설명하기 위한 방법으로 폭넓게 신뢰받고 있다. 이에 본 논문에서는 중심-치명 룰이 항상 옳게 적용되는지를 확인하기 위해 Uetz, Ito, MIPS, DIP, SGD, BioGRID와 같은 효모에 관한 공개된 모든 단백질 상호작용 데이터베이스들을 분석하였다. 흥미롭게도, 상호작용 데이터가 적은 데이터베이스들(Uetz, Ito, DIP)에서는 중심-치명 룰을 잘 나타냈지만 상호작용 데이터가 대용량인 데이터베이스들 (SGD, BioGRID)에서는 중심-치명 룰이 잘 맞지 않음을 확인하였다. 이에 따라 SGD와 BioGRID 데이터 베이스로 부터 얻은 상호작용 네트워크의 특징을 분석하고 DIP 데이터베이스의 상호작용 네트워크와 비교하였다.

#단백질-단백질 상호작용 네트워크 #필수 단백질 #허브 단백질 #Protein-Protein Interaction Network #Essential Protein #Hub Protein

참고문헌 (17)

참고문헌 신청

1. [학술지(정기간행물)] - E. Ravasz / 2003 / Hierarchical organization in complex networks / Phys. Rev. E 67 (2) : 026122 ~ 0261228

2. [학술지(정기간행물)] - A. L. Barabasi / 2004 / Network biology: understanding the cell's functional organization / Nat. Rev. Genet 5 (2) : 101 ~ 113

3. [학술지(정기간행물)] - N. N. Batada / 2006 / Evolutionary and physiologucal important of hub proteins / Plos Comput. Biol 2 (7) : e88 ~

4. [학술지(정기간행물)] - H. Jeong / 2001 / Lethality and centrality in protein networks / Nature 411 (6833) : 41 ~ 42

5. [학술지(정기간행물)] - S. R. Proulx / 2007 / Direct selection on genetic robustness revealed in the yeast transcriptome / PLos ONE 2 (9) : e911 ~

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

유제운

소속기관 질병관리청

주요연구분야 복합학 > 학제간연구 TOP 1%

논문수 18 이용수 8,308

강태호

소속기관 충북대학교 정보통신공학과

주요연구분야 공학 > 컴퓨터학 복합학 > 학제간연구

논문수 25 이용수 1,968

유재수

소속기관 충북대학교 전기전자컴퓨터공학부

주요연구분야 공학 > 컴퓨터학 TOP 5% 복합학 > 학제간연구 TOP 0.5%

논문수 612 이용수 73,054

김학용

소속기관 충북대학교

주요연구분야 복합학 > 학제간연구 TOP 0.5% 공학 > 전기전자공학

논문수 66 이용수 19,594

이 논문과 함께 이용한 논문

단백질 상호작용 네트워크 및 유전자 발현값을 이용한 중복 허용 단백질 복합체 탐색 방법

안재균 , 여윤구 , 윤영미 외 1명 정보과학회논문지 : 데이타베이스 2012 .06

단백질 허브 네트워크에서 도메인분석을 통한 단백질 기능발견 시스템

강태호 , 류제운 , 유재수 외 1명 한국콘텐츠학회논문지 2008 .01

국내 전국 시·군과 도시 인구규모별 녹지 접근성 평가 - 보행특성 기반의 네트워크 분석의 적용 -

고찬우 , 황병묵 , 임도혁 외 2명 한국지적정보학회지 2023 .04

보행 네트워크 분석을 통한 서울시 공원 접근성 평가

황병묵 , 고찬우 , 김정현 외 2명 한국지적정보학회지 2022 .04

대중교통 네트워크 중심의 접근성을 기준으로 한 제주도 대중교통 개편 효과 분석 - 대중교통 통행시간의 시간적 변동을 고려하여 -

심재웅 , 조기혁 국토계획 2019 .11

최근 본 자료

전체보기

UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2009-004-014850745

구분	그룹	데이터 항목
AI 학습용 데이터	원문	원문 PDF 파일
AI 학습용 데이터	원문 + 메타 (기본/상세)	원문 PDF 파일 및 서지정보 CSV
대량 구매용 데이터	B2B 구독 방식	특정 자료 한정으로 원문 접근 권한 부여
대량 구매용 데이터	URL 전달 방식	바로 PDF 뷰어를 열람할 수 있는 URL 제공

구분	그룹	데이터 항목
AI 학습용 데이터	기본 메타	발행기관명, 간행물명, 권호명, 권(vol), 호(issue), 통권, 발행연도, 발행월, 논문명, 저자명, 시작페이지, 종료페이지, 전체페이지, 상세페이지URL
상세 메타 데이터	발행기관 메타	발행기관 이명, 영문명, 창립연도, 홈페이지URL, 발행기관 소개
	간행물 메타	부제목, 간행물 유형, ISSN, ISBN, 최초발행연도, 폐간연도, 간행빈도, 발행주기, 등재사항, 이용수, 피인용수, 권호수, 논문수, 표지이미지
	논문 메타	작성 언어, 부제목, 대등제목, 목차, 키워드, 초록, 이미지, 참고문헌, 이용수, 피인용수, 논문활용도, DBpia통합주제분류, KDC분류, DDC분류, 한국연구재단분류, UCI, DOI
	저자 메타	소속기관, 소속부서, 직급, 연구분야, 연구키워드, 이용수, 피인용수, 저자 논문활용도

구분	그룹	데이터 항목
※ 결합형/맞춤형 메타 데이터는 신청 내용에 따라 다양하게 제공 가능
이용순위 정보	주제분야별 많이 이용된 논문	“인문학”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	이용기관별 많이 이용된 논문	“중고등학교”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	세부기관별 많이 이용된 논문	“서울대학교”에서 많이 이용된 논문 TOP100
	키워드별 많이 이용된 논문	“Chat GPT”에서 많이 이용된 논문 TOP100
키워드 정보	많이 이용된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 이용된 키워드
	많이 발행된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 발행된 키워드
	많이 검색된 키워드	특정기간/분야/저널 내 많이 검색된 키워드
	연구 트렌드 키워드	특정 키워드 연관 연구동향 분석 데이터 키워드

논문 기본 정보

초록· 키워드

AI 요약

연구주제

연구배경

연구방법

연구결과

주요내용

목차

참고문헌 (17)

함께 읽어보면 좋을 논문

이 논문의 저자 정보

이 논문과 함께 이용한 논문

최근 본 자료

댓글(0)