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한국원예학회 HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY JOURNAL OF THE KOREAN SOCIETY FOR HORTICULTURAL SCIENCE Vol.45 No.6
발행연도
2004.12
수록면
349 - 353 (5page)

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이 논문의 연구 히스토리 (3)

2004

Comparative Analysis of Single- and Double-Flowered Camellia japonica Based on Internal Transcribed Spacer Sequences of Nuclear Ribosomal DNA
Yong-Hwan Jung ,  Kong Ho Kim ,  Misun Kim 외 2명 HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY 2004.12 학술저널
Comparative Analysis of Single-and Double-Flowered Camellia japonica Based on the ITS Sequences of Nuclear Ribosomal DNA
Yong-Hwan Jung ,  Kong Ho Kim ,  Misun Kim 외 1명 한국원예학회 학술발표요지 2004.10 학술대회자료
Genetic Analysis of Blueberry (Vaccinium, Ericaceae) Cultivars Based on ITS Sequences of Nuclear Ribosomal DNA
Yong-Hwan Jung ,  Misun Kim ,  Doo Young Moon 외 5명 한국원예학회 학술발표요지 2004.05 학술대회자료

초록· 키워드

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A comparative analysis of single- and double-flowered Camellia japonica distributed on Jeju Island, Korea, was done with using the internal transcribed spacer (ITS) sequences of the nuclear ribosomal DNA (nrDNA). The nrDNA ITS region of C. japonica was amplified directly by polymerase chain reaction (PCR) using the universal primers ITS1 and ITS4. The length of the ITS region varied from 641 bp (double-flowered) to 645 bp (single-flowered), including 165-bp 5.8S rRNA gene. Sequence alignment required one insertion/deletion in ITS1 and ITS2 of C. japonica. The longest mutation was eight-bp deletion in the ITS2 of all double-flowered C. japonica. Four-bp deletion was detected in the ITS1 of all single-flowered C. japonica. In addition, a repetitive motif, ACGA, was found in the ITS1 region of C. japonica. The double-flowered C. japonica contained three repeats, while the single-flowered contained two. The nucleotide sequence of the ITS region contained eleven base substitutions. Seven of the base substitutions differed completely in single- and double-flowered C. japonica. Therefore, nrDNA ITS sequences are useful for the genetic characterization of single- and double-flowered C. japonica distributed in Jeju Island, Korea. These results may also be used as basic data for breeding of C. japonica.
#base substitution #mutation #nucleotide sequence #repetitive motif

목차

Abstract
Introduction
Materials and Methods
Results and Discussion
Acknowledgement
Literature Cited

참고문헌 (27)

참고문헌 신청
[학술지(정기간행물)] - / 1992 / Phylogenetic utility of the internal transcribed spacers of nuclear ribosomal DNA in plants An example from the Compositae e google schola [학술지(정기간행물)] - / 1993 / Molecular phylogenetics of Calycadenia based on ITS sequences of nuclear ribosomal DNA google schola [학술지(정기간행물)] - / 1995 / The ITS region of nuclear ribosomal DNA: A valuable source of evidence of angiosperm phylogeny. 82 : 247 ~ 277 google schola [학술지(정기간행물)] - / 1996 / Genetic variation within and among populations of Camellia japonica (Theaceae) in Korea. 26 : 537 ~ 542 google schola [학술지(정기간행물)] - / 1984 / Molecular evolution of chloroplast DNA sequences e google schola

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2009-525-016908986