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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학위논문
- 저자정보
- 지도교수
- 이영주.
- 발행연도
- 2021
- 저작권
- 경북대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.
이용수17
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소와 사슴결핵 (TB)은 Mycobacterium bovis에 의해 발생하며 다양한 분자적 연구로 발생 및 전파에 관련한 연구가 이루어지고 있다. 그러나 국내에서는 M. bovis에 대한 상세한 게놈 수준 연구는 많이 이루어지지 않았다. 본 연구에서는 한국의 M. bovis 야외 분리주에서 전체 게놈 단일 염기 다형성(Single-nucleotide polymorphism, SNP) 변이체를 조사하고 SNP 유형과 spoligotyping 및 VNTR 유형을(Variable-number tandem repeat) 비교하여 한국의 M. bovis 그룹을 세부적으로 타이핑할 수 있는 기반마련을 위한 연구를 진행했다. 한우, 멧돼지, 사슴의 인후두 림프절과 폐에서 분리 한 총 46 종의 M. bovis 야외 분리주를 사용하여 전체 게놈 염기 서열 분석을 수행하여 SNP를 확인 하였다. SNP 부위는 87 개의 프라이머 쌍을 사용하여 중합 효소 연쇄 반응을 통해 확인되었다. M. bovis 분리주에서 빈도가 다른 34 개의 SNP 부위를 확인하고 SNP 유형 및 역학 분석을 수행하여 46 개의 필드 분리주를 16 개의 하위 유형으로 나누었다. SNP 분석을 통해 동일한 spoligotype와 VNTR type을 가진 균주들의 세부적인 차이를 발견할 수 있었다. SNP 분석은 소 결핵을 더 잘 관리할 수 있는 유용한 역학 추적 도구이며, 따라서 이 질병의 전파를 효과적으로 통제하고 추가 발생을 예방할 수 있을 것으로 전망된다. 농가에 존재하는 잔류 M. bovis는 소결핵병 재발생의 주요 원인 중 하나이기 때문에 환경 샘플에서 M. bovis를 정밀하게 검출하는 것은 우군 수준에서 소결핵(bTB) 감염을 제어하는 데 필수적이다. 이 연구에서는 결핵균의 환경에서의 잠재적인 잔류성을 식별하기 위해 환경 샘플에서 M. bovis 검출을 위한 중첩 PCR(Nested PCR) 방법을 적용했다. bTB 발병 이력이 있는 39 개 농장의 환경 시료 200 개(분변 시료 167 개 및 물 시료 33 개)를 Nested PCR 방법을 사용하여 분석하여 잔류 M. bovis를 검출했다. 결핵균 표적 유전자인 IS 6110 유전자 단편은 2 개의 확립된 프라이머 세트를 사용하여 M. bovis DNA로부터 증폭되었다. 분변 샘플의 69.5%와 물 샘플의 66.7%에서 PCR 결과가 양성으로 관찰되어 잔류 M. bovis가 bTB 양성 농장 환경 샘플에서 높은 비율로 존재함을 보여주었다. 이 연구는 환경 샘플에서 높은 수준의 M. bovis DNA의 존재를 입증했으며, 또한 이 병원체의 환경에서의 잔류가 bTB의 재발에 기여할 가능성 보여주었다. Nested PCR 방법의 높은 민감도와 특이도를 이용한 bTB 발생농가에 대한 환경 모니터링은 잠재적인 bTB 질병의 재발을 예방하고 가축 환경을 개선하는 데 도움이 될 것으로 기대된다.
목차
GENERAL INTRODUCTION 1CHAPTER 1. Single-nucleotide polymorphism-based epidemiological analysis of Korean Mycobacterium bovis isolates 61. ABSTRACT 72. INTRODUCTION 83. MATERIALS AND METHODS 104. RESULTS 185. DISCUSSION 35CHAPTER2. Detection of Mycobacterium bovis in environmental samples using nested PCR 401. ABSTRACT 412. INTRODUCTION 423. MATERIALS AND METHODS 444. RESULTS 525. DISCUSSION 62REFERENCES 68ABSTRACT (in Korean) 81
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