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학술저널
저자정보
Marbun Kristin Talia (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Sugata Marcelia (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Purnomo Jonathan Suciono (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Dikson (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Mudana Samuel Owen (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Jan Tan Tjie (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, Indonesia) Jo Juandy (Department of Biology, Faculty of Science and Technology, Universitas Pelita Harapan, Tangerang 15811, IndonesiaMochtar Riady Institute for Nanotechnology, Tangerang 15811, Indonesia)
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology Vol.34 No.4
발행연도
2024.4
수록면
871 - 879 (9page)
DOI
10.4014/jmb.2311.11031

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Our group had isolated Bifidobacterium breve strain BS2-PB3 from human breast milk. In this study, we sequenced the whole genome of B. breve BS2-PB3, and with a focus on its safety profile, various probiotic characteristics (presence of antibiotic resistance genes, virulence factors, and mobile elements) were then determined through bioinformatic analyses. The antibiotic resistance profile of B. breve BS2-PB3 was also evaluated. The whole genome of B. breve BS2-PB3 consisted of 2,268,931 base pairs with a G-C content of 58.89% and 2,108 coding regions. The average nucleotide identity and whole-genome phylogenetic analyses supported the classification of B. breve BS2-PB3. According to our in silico assessment, B. breve BS2-PB3 possesses antioxidant and immunomodulation properties in addition to various genes related to the probiotic properties of heat, cold, and acid stress, bile tolerance, and adhesion. Antibiotic susceptibility was evaluated using the Kirby-Bauer disk-diffusion test, in which the minimum inhibitory concentrations for selected antibiotics were subsequently tested using the Epsilometer test. B. breve BS2-PB3 only exhibited selected resistance phenotypes, i.e., to mupirocin (minimum inhibitory concentration/MIC >1,024 μg/ml), sulfamethoxazole (MIC >1,024 μg/ml), and oxacillin (MIC >3 μg/ml). The resistance genes against those antibiotics, i.e., ileS, mupB, sul4, mecC and ramA, were detected within its genome as well. While no virulence factor was detected, four insertion sequences were identified within the genome but were located away from the identified antibiotic resistance genes. In conclusion, B. breve BS2-PB3 demonstrated a sufficient safety profile, making it a promising candidate for further development as a potential functional food.
#Bifidobacterium breve #human breast milk #microbiota #antibiotic resistance #probiotic safety

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