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저자정보
이상범 (농촌진흥청 국립농업과학원) 김규원 (공주대학교) 윤민영 (공주대학교) 김경진 (농촌진흥청 국립농업과학원 농산물안전성부 화학물질안전과) 류지혁 (국립농업과학원 농산물안전성부) 김원일 (농촌진흥청 국립농업과학원) 문병철 (농촌진흥청 국립농업과학원) 박상원 (농촌진흥청 국립농업과학원) 박용진 (공주대학교)
저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제48권 제4호
발행연도
2016.12
수록면
470 - 485 (16page)
DOI
http://dx.doi.org/10.9787/KJBS.2016.48.4.470

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이 논문의 연구 히스토리 (3)

2017

온대자포니카 벼 품종의 등숙기 종자 내 카드뮴 함량에 관한 전장유전체연관분석
이상범 식물자원학과 2017.01 학위논문

2016

온대자포니카 벼 품종의 등숙기 종자 내 카드뮴 함량에 관한 전장유전체연관분석
이상범 ,  김규원 ,  윤민영 외 6명 한국육종학회지 2016.12 학술저널
Temperate Japonica 품종의 카드뮴 함량에 관한 전장유전체연관분석
이상범 ,  김원일 ,  박용진 외 3명 한국토양비료학회 학술발표회 초록집 2016.03 학술대회자료

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본 연구는 비오염지 논에서 재배된 벼 품종 280점의 카드뮴함량의 차이를 조사하고 카드뮴 함량과 관련된 유전자를 확인하고자 수행하였다. 벼 종자를 산분해법으로 전처리 한 뒤 유도결합플라즈마질량분석기(ICP-MS)로 카드뮴 함량을 분석한 결과평균 0.943 (0.050~5.699) ㎍/㎏ 수준이었다. 그리고 국내외에서 수집한 유전자원 280점을 선발하여 생태형 (온대자포니카, 열대자포니카, 인디카, Aus, Aromatic 및 Admixture) 별로 구분한 뒤, 전장유전체(whole genome)에 대한 유전자 분석 및 각각의 염색체에 대한 단일염기다형성(SNP)을 분석한 후 온대자포니카 계통 182점의 등숙기 종자 내 카드뮴 함량을 전장유전체분석하여 카드뮴과 연관된 후보유전자를 확인하였다. 그리고Os01g0611300, Os01g0611900, Os01g0611950, Os01g0612 000, Os01g0612200, Os11g0444400, Os11g0444700, Os11g 0444800 및 Os11g0444900 등의 후보유전자가 쌀알 중의 카드뮴 함량과 강한 상관관계가 있음을 확인하였다. 후보유전자들에대한 haplotype 분석 결과 온대자포니카 임에도 allele들을 갖는염색체 1번의 9개 품종과 염색체 11번의 33개 품종은 인디카에서 유래되어 온 품종들일 가능성이 높을 것으로 판단되었고, 인디카가 대체적으로 자포니카에 비해 등숙기 종자 내 카드뮴함량이 높다는 기존의 보고들과 유사하였다.
#Genome-wide association study #Cadmium #Haplotype #Ecotype #Candidate genes

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참고문헌 (17)

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Arao T. / 2003 / Genotypic variations in cadmium levels of rice grain / Soil Sci. Plant Nutr 49:473~479 google schola Arao T / 2006 / Genotypic differences in cadmium concentration and distribution of soybean and rice / JARQ 40:21~30 google schola Horiguchi H / 2010 / Latest status of cadmium accumulation and its effects on kidneyes, bone, and erythropoiesis in inhabitants of the formerly cadmium-polluted Jinzu River Basin in Toyama, Japan, after restoration of rice paddies / Int.Arch.Occup. Environ. Health 83:953~970 google schola Huang X / 2012 / Genome-wide association study of flowering time and grain yield traits in a worldwide collection of rice germplasm / Nature genetics 44:32~39 google schola 2010 / Joint FAO/WHO Expert Committee on Food Additives :73 google schola

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