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저자정보
Kha The Nguyen (Pohang University of Science and Technology) 주신영 (한국과학기술연구원) Sang-Yoon Kim (Pohang University of Science and Technology) 이창석 (포항공과대학교) Cheolju Lee (Korea Institute of Science and Technology) Cheol-Sang Hwang (Pohang University of Science and Technology)
저널정보
한국분자세포생물학회 Molecules and Cells Molecules and Cells 제45권 제3호
발행연도
2022.3
수록면
158 - 167 (10page)
DOI
10.14348/molcells.2022.2027

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Ubiquitin (Ub) is post-translationally modified by Ub itself or Ub-like proteins, phosphorylation, and acetylation, among others, which elicits a variety of Ub topologies and cellular functions. However, N-terminal (Nt) modifications of Ub remain unknown, except the linear head-to-tail ubiquitylation via Nt-Met. Here, using the yeast Saccharomyces cerevisiae and an Nt-arginylated Ub-specific antibody, we found that the detectable level of Ub undergoes Nt-Met excision, Nt-deamination, and Nt-arginylation. The resulting Nt-arginylated Ub and its conjugated proteins are upregulated in the stationary-growth phase or by oxidative stress. We further proved the existence of Nt-arginylated Ub in vivo and identified Nt-arginylated Ub-protein conjugates using stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC)-based tandem mass spectrometry. In silico structural modeling of Nt-arginylated Ub predicted that Nt-Arg flexibly protrudes from the surface of the Ub, thereby most likely providing a docking site for the factors that recognize it. Collectively, these results reveal unprecedented Nt-arginylated Ub and the pathway by which it is produced, which greatly expands the known complexity of the Ub code.

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