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자료유형
학술저널
저자정보
박로빈 (고려대학교) 김태환 (한양대학교) 지종대 (고려대학교)
저널정보
대한류마티스학회 대한류마티스학회지 대한류마티스학회지 제23권 제6호
발행연도
2016.1
수록면
363 - 372 (10page)

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Objective. To identify a gene expression signature in axial spondyloarthritis/ankylosing spondylitis (SpA/AS) and genomic pathways likely to be involved in pathogenesis of SpA/AS patients. Methods. Four publicly accessible microarray studies from SpA/AS patients were integrated, and a transcriptomic and network-based meta-analysis was performed. This meta-analysis was compared with a published microarray study in whole blood of AS patients. Results. According to our meta-analysis, 1,798 genes were differentially expressed in the whole blood of SpA/AS patients compared to healthy controls, while 674 genes were differentially expressed in the synovium of SpA/AS patients compared to healthy controls. When the whole blood meta-analysis data was compared with a published microarray study that also analyzed whole blood in SpA/AS patients, pathways involved in Toll-like receptor signaling, osteoclast differentiation, T cell receptor signaling and janus kinase–signal transducer and activator of transcription (Jak-STAT) signaling were often enriched in SpA/AS. On the other hand, eomesodermin, RUNX3, and interleukin- 7 receptor (IL7R) were usually decreased in SpA/AS patients, suggesting that deficiency of these genes contributes to increased IL-17 production in AS. Conclusion. Several common enrichment pathways including Toll-like receptor signaling pathway, osteoclast differentiation, T cell receptor signaling pathway and Jak-STAT signaling pathway were identified in the differentially expressed genes of whole blood and synovium from SpA/AS patients, suggesting that these pathways are involved in the pathogenesis of SpA/AS. (J Rheum Dis 2016;23:363-372)

목차

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참고문헌 (35)

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Garg N / 2014 / The concept of spondyloarthritis:where are we now? / Best Pract Res Clin Rheumatol 28:663~672 google schola de Vlam K / 2010 / Soluble and tissue biomarkers in ankylosing spondylitis / Best Pract Res Clin Rheumatol 24:671~682 google schola Häupl T / 2010 / Does gene expression analysis inform us in rheumatoid arthritis? / Ann Rheum Dis 69(Suppl 1):i37~i42 google schola Bauer JW / 2009 / Gene-expression profiling in rheumatic disease: tools and therapeutic potential / Nat Rev Rheumatol 5:257~265 google schola Smith JA / 2008 / Gene expression analysis of macrophages derived from ankylosing spondylitis patients reveals interferon-gamma dysregulation / Arthritis Rheum 58:1640~1649 google schola

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