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저자정보
전윤선 (연세대학교) 차재국 (연세대학교) 최성호 (연세대학교) 이지현 (경희대학교) 이중석 (연세대학교)
저널정보
대한치주과학회 Journal of Periodontal & Implant Science Journal of Periodontal & Implant Science 제50권 제5호
발행연도
2020.1
수록면
313 - 326 (14page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2021

Transcriptomic profiles and their correlations in saliva and gingival tissue biopsy samples from periodontitis and healthy patients
전윤선 2021.01 학위논문

2020

Transcriptomic profiles and their correlations in saliva and gingival tissue biopsy samples from periodontitis and healthy patients
전윤선 ,  차재국 ,  최성호 외 2명 Journal of Periodontal & Implant Science 2020.01 학술저널

초록· 키워드

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Purpose: This study was conducted to analyze specific RNA expression profiles in gingival tissue and saliva samples in periodontitis patients and healthy individuals, and to determine their correlations in light of the potential use of microarray-based analyses of saliva samples as a periodontal monitoring tool. Methods: Gingival tissue biopsies and saliva samples from 22 patients (12 with severe periodontitis and 10 with a healthy periodontium) were analyzed using transcriptomic microarray analysis. Differential gene expression was assessed, and pathway and clustering analyses were conducted for the samples. The correlations between the results for the gingival tissue and saliva samples were analyzed at both the gene and pathway levels. Results: There were 621 differentially expressed genes (DEGs; 320 upregulated and 301 downregulated) in the gingival tissue samples of the periodontitis group, and 154 DEGs (44 upregulated and 110 downregulated) in the saliva samples. Nine of these genes overlapped between the sample types. The periodontitis patients formed a distinct cluster group based on gene expression profiles for both the tissue and saliva samples. Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery analysis revealed 159 enriched pathways from the tissue samples of the periodontitis patients, as well as 110 enriched pathways In the saliva samples. Thirty-four pathways overlapped between the sample types. Conclusions: The present results indicate the possibility of using the salivary transcriptome to distinguish periodontitis patients from healthy individuals. Further work is required to enhance the extraction of available RNA from saliva samples.
#Microarray analysis #Periodontitis #Saliva #Transcriptome

목차

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참고문헌 (34)

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Al-Yahfoufi Z / 1995 / The effect of plaque control in subjects with shallow pockets and high prevalence of periodontal pathogens / J Clin Periodontol 22:78~84 google schola Trombelli L / 2004 / Modulation of clinical expression of plaque-induced gingivitis. II. Identification of “high-responder” and “low-responder” subjects / J Clin Periodontol 31:239~252 google schola Löe H / 1986 / Natural history of periodontal disease in man. Rapid, moderate and no loss of attachment in Sri Lankan laborers 14 to 46 years of age / J Clin Periodontol 13:431~445 google schola Halazonetis TD / 1989 / Relationship of clinical parameters to attachment loss in subsets of subjects with destructive periodontal diseases / J Clin Periodontol 16:563~568 google schola Gonçalves LDR / 2010 / Comparative proteomic analysis of whole saliva from chronic periodontitis patients / J Proteomics 73:1334~1341 google schola

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