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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술대회자료
- 저자정보
- 발행연도
- 2021.4
- 수록면
- 28 - 28 (1page)
이용수
이 논문의 연구 히스토리 (2)
2021
Genome-wide Multi-omics Analysis of Mucin-degrading Bacteria Reveals Their Nutrient-dependent Distinct Metabolic Features in the Human Gut
Kyoung Su KIM
,
Ji-Young LEE
,
Hyeon-Su JIN
외 1명
한국생물공학회 학술대회
2021.04
학술대회자료
Genome-wide Multi-omics Analysis of Mucin-degrading Bacteria Reveals Their Nutrient-dependent Distinct Metabolic Features in the Human Gut
Kyoung Su KIM
,
Dong-Woo LEE
한국생물공학회 학술대회
2021.04
학술대회자료
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Diet-driven gut microbiota is highly associated with human health and diseases. Mucin-degrading (MD) bacteria play a crucial role in shaping commensal microbiota's structure and function in the human gut, but their metabolic features remain elusive. Herein we performed a genome-wide analysis to investigate the nutrient-dependent physiology and metabolism of MD bacteria. The genome sequences of Ruminococcus gnavus ATCC 29149 (RG, 3.55 Mb) and Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835 (AM, 2.66 Mb) reveal that they contained 3,345 and 2246 protein-encoding genes, respectively, according to the NCBI Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP). However, the PGAP annotations exhibited >60% mismatches with those from different pipeline configurations. Accordingly, we revised the genome annotations of both MD bacteria using the UniProtKB/Swiss-Prot database, followed by additional manual ... 전체 초록 보기
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