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Rhodobacteraceae 과에 속하는 신종 해양 세균은 대한민국 포항의 해안가에서 채집한 적조류로부터 분리되었으며 PG104 균주로 명명하였다. 이 균주의 유전체는 66.68% GC 함량과 2,279,458 bp 크기를 가진 1개의 염색체와 5개의 플라스미드(크기가 44,911 bp에서 175,961 bp 범위에 속하는 플라스미드 pL104-1, pL104-2, pL104-3, pL104-4, pL104-5)로 구성되어 있다. 또한 2,643개의 단백질-코딩 염기서열, 51개의 tRNA 유전자 및 9개의16S-23S-5S 관련 rRNA operon를 포함한다. 나아가 PG104 균주의 유전체에는 해조류 유래 다당류를 분해할 수 있는 알긴산 분해효소 유전자가 존재하는 것으로 나타났다.
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Blin K, Shaw S, Steinke K, Villebro R, Ziemert N, Lee SY, Medema MH, and Weber T. 2019. antiSMASH 5.0: updates to the secondary metabolite genome mining pipeline. Nucleic Acids Res. 47, W81?W87.
Buchan A, Gonzalez JM, and Moran MA. 2005. Overview of the marine Roseobacter lineage. Appl. Environ. Microbiol. 71, 5665? 5677.
Garrity GM, Bell JA, and Lilburn T. 2005. Family I. Rhodobacteraceae fam. nov, pp. 161. In Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, and Garrity GM (eds.), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology: the proteobacteria vol. 2. Springer, New York, USA.
Lombard V, Bernard T, Rancurel C, Brumer H, Coutinho PM, and Henrissat B. 2010. A hierarchical classification of polysaccharide lyases for glycogenomics. Biochem. J. 432, 437?444.
Mori T, Takahashi M, Tanaka R, Miyake H, Shibata T, Chow S, Kuroda K, Ueda M, and Takeyama H. 2016. Falsirhodobacter sp. alg1 harbors single homologs of endo and exo-type alginate lyases efficient for alginate depolymerization. PLoS ONE 11, e0155537.
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Garrity GM, Bell JA, and Lilburn T. 2005. Family I. Rhodobacteraceae fam. nov, pp. 161. In Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, and Garrity GM (eds.), Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology: the proteobacteria vol. 2. Springer, New York, USA.
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