Detection of Mycoplasma Infection in Cultured Cells on the Basis of Molecular Profiling of Host Responses

Chung, Tae Su; Kim, Ju Han; Lee, Young-Ju; Park, Woong-Yang

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자료유형: 학술저널

저자정보: Chung, Tae Su (Seoul National University Biomedical Informatics, Seoul National University College of Medicine) Kim, Ju Han (Seoul National University Biomedical Informatics, Seoul National University College of Medicine) Lee, Young-Ju (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Seoul National University College of Medicine) Park, Woong-Yang (Department of Biochemistry and Molecular Biology, Seoul National University College of Medicine)

저널정보: 한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제3권 제3호

발행연도: 2005.1

수록면: 63 - 67 (5page)

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Adaptive responses to diverse microbial pathogens might be limited in relatively few types. Host cell responses to pathogens are believed to be patterned or stereotyped along with species or class. We tried to compose the host response to Mycoplasma in terms of cellular gene expression. Although gene expression profile of two host HeLa and 293 cells were quite different each other, 30 genes were differentially expressed by mycoplasma infection in both of HeLa and 293 cells. Six of them (PR48, MADH4, MKPX, CRK, RBM7, NEK3) were related to cell cycle or proliferation. Another category of genes like IL1 HY1, KLRF1, TNFSF14, GBP1 were host defense to elicit immune responses. With this set of genes, we establish the prediction model for mycoplasma contamination.

#Mycoplasma #oligonucleotide microarray #prediction model #biomarker

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Chung, Tae Su

소속기관 Seoul National University Biomedical Informatics [SNUBI], Human Genome Research Institute, Seoul Nat

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논문수 3 이용수 2

Kim, Ju Han

소속기관 Seoul National University Biomedical Informatics [SNUBI], Division of Biomedical Informatics and Sys

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Lee, Young-Ju

소속기관 Department of Biochemistry and Molecular Biology, Seoul National University College of Medicine

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Park, Woong-Yang

소속기관 Genomics Core Laboratory and Departments of Biochemistry and Molecular Biology, Seoul National Unive

주요연구분야 자연과학 > 생물학

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