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저자정보
Inoue, Etsuko (Graduate School of Systems Engineering, Wakayama University) Yoshihiro, Takuya (Faculty of Systems Engineering, Wakayama University) Kawaji, Hideya (NTT Software Corporation) Horibata, Akira (Faculty of Biology-Oriented Science and Technology, Kinki University) Nakagawa, Masaru (Faculty of Systems Engineering, Wakayama University)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 한국생물정보시스템생물학회 학술대회 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
발행연도
2005.1
수록면
15 - 20 (6page)

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We developed a database system to enable efficient and high-throughput transposon analyses in rice. We grow large-scale mutant series of rice by taking advantage of an active MITE transposon mPing, and apply the transposon display method to them to study correlation between genotypes and phenotypes. But the analytical phase, in which we find mutation spots from waveform data called fragment profiles, involves several problems from a viewpoint of labor amount, data management, and reliability of the result. As a solution, our database system manages all the analytical data throughout the experiments, and provides several functions and well designed web interfaces to perform overall analyses reliably and efficiently.

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