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저자정보
Orii, Shigeo (Science Solutions Group, FUJITSU LTD.) Anai, Hirokazu (IT Core Laboratories, FUJITSU LABORATOLIES LTD.-JST, CREST.) Horimoto, Katsuhisa (Laboratory of Biostatistics, Institute of Medical Science, University of Tokyo)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 한국생물정보시스템생물학회 학술대회 한국생물정보시스템생물학회 2005년도 BIOINFO 2005
발행연도
2005.1
수록면
272 - 277 (6page)

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We introduce a new approach to optimize the parameters in biological kinetic models by quantifier elimination (QE), in combination with numerical simulation methods. The optimization method was applied to a model for the inhibition kinetics of HIV proteinase with ten parameters and nine variables, and attained the goodness of fit to 300 points of observed data with the same magnitude as that obtained by the previous optimization methods, remarkably by using only one or two points of data. Furthermore, the utilization of QE demonstrated the feasibility of the present method for elucidating the behavior of the parameters in the analyzed model. The present symbolic-numeric method is therefore a powerful approach to reveal the fundamental mechanisms of kinetic models, in addition to being a computational engine.

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