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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제53권 제6호
발행연도
2020.1
수록면
299 - 310 (12page)

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Chronic liver disease progresses through several stages, fatty liver, steatohepatitis, cirrhosis, and eventually, it leads to hepatocellular carcinoma (HCC) over a long period of time. Since a large proportion of patients with HCC are accompanied by cirrhosis, it is considered to be an important factor in the diagnosis of liver cancer. This is because cirrhosis leads to an irreversible harmful effect, but the early stages of chronic liver disease could be reversed to a healthy state. Therefore, the discovery of biomarkers that could identify the early stages of chronic liver disease is important to prevent serious liver damage. Biomarker discovery at liver cancer and cirrhosis has enhanced the development of sequencing technology. Next generation sequencing (NGS) is one of the representative technical innovations in the biological field in the recent decades and it is the most important thing to design for research on what type of sequencing methods are suitable and how to handle the analysis steps for data integration. In this review, we comprehensively summarized NGS techniques for identifying genome, transcriptome, DNA methylome and 3D/4D chromatin structure, and introduced framework of processing data set and integrating multi-omics data for uncovering biomarkers.

목차

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Luo P / 2018 / A Large-scale, multicenter serum metabolite biomarker identification study for the early detection of hepatocellular carcinoma / Hepatology 67:662~675 google schola Miao R / 2014 / Identification of prognostic biomarkers in hepatitis B virus-related hepatocellular carcinoma and stratification by integrative multiomics analysis / J Hepatol 61:840~849 google schola Wu Z / 2020 / Genomic subtyping of liver cancers with prognostic application / BMC Cancer 20:84 google schola Tahmasebi S / 2018 / Translation deregulation in human disease / Nat Rev Mol Cell Biol 19:791~807 google schola Ng SB / 2009 / Targeted capture and massively parallel sequencing of 12 human exomes / Nature 461:272~276 google schola

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